234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1163 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1163  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 		 261 aa  519  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1347  flagellar basal body rod modification protein  75.1 
 
 		 260 aa  391  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.796846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1305  flagellar basal body rod modification protein  74.05 
 
 		 263 aa  384  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1599  flagellar basal body rod modification protein  79.74 
 
 		 270 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1342  flagellar basal body rod modification protein  71.11 
 
 		 270 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  72.29 
 
 		 282 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2595  flagellar basal body rod modification protein  69.73 
 
 		 253 aa  362  3e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1331  flagellar basal body rod modification protein  69.92 
 
 		 256 aa  362  4e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2945  flagellar basal body rod modification protein  70.5 
 
 		 256 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1418  flagellar basal body rod modification protein  70.88 
 
 		 256 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3098  flagellar basal body rod modification protein  70.5 
 
 		 256 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2960  flagellar basal body rod modification protein  70.5 
 
 		 256 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198197  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1323  flagellar basal body rod modification protein  68.85 
 
 		 259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1261  flagellar basal body rod modification protein  69.47 
 
 		 256 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2316  flagellar basal body rod modification protein  67.82 
 
 		 242 aa  354  6.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.383064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3248  flagellar basal body rod modification protein  68.8 
 
 		 253 aa  345  5e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  50.99 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  45.37 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01288  flagellar basal body rod modification protein  47.35 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  47.77 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3098  flagellar basal body rod modification protein  43.81 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02926  flagellar basal body rod modification protein  42.06 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1479  basal-body rod modification protein FlgD  41.55 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  36.19 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  37.44 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  39.81 
 
 		 221 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  39.81 
 
 		 221 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  37.44 
 
 		 225 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  40.31 
 
 		 234 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  35.53 
 
 		 233 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  38.78 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  37.79 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  39.05 
 
 		 225 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  35.53 
 
 		 233 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  37.19 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  37.19 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  38.46 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  37.37 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  33.84 
 
 		 222 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  35.51 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  35.61 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  33.88 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  34.58 
 
 		 229 aa  118  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  31.42 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  32.39 
 
 		 225 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  33.61 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  32.39 
 
 		 225 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  32.39 
 
 		 225 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  35.36 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  31.47 
 
 		 226 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  31.05 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  33.85 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  36.21 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  30.41 
 
 		 222 aa  99.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  30.77 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  35.53 
 
 		 215 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  35.53 
 
 		 215 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  35.18 
 
 		 225 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  35.5 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  33.74 
 
 		 248 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  33.74 
 
 		 248 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  32.67 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  32.67 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  32.67 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  32.67 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  34.01 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  32.67 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  32.67 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  32.67 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  34.01 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  35.37 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  32.35 
 
 		 228 aa  93.6  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  34.64 
 
 		 240 aa  92  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  31.89 
 
 		 224 aa  92  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  31.25 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  32.31 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  30.57 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  34.21 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1976  flagellar basal body rod modification protein  32.31 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  33.96 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  33.96 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  33.96 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  35 
 
 		 228 aa  89.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  33.96 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  33.96 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  33.96 
 
 		 231 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  33.96 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 231 aa  89  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 223 aa  89  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  30.28 
 
 		 234 aa  88.6  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  32.12 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  33.33 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  30.15 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  35 
 
 		 225 aa  88.6  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  34.5 
 
 		 228 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  32.88 
 
 		 248 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  31.97 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  32.88 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 231 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>