258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1904 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 
227 aa  462  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  60.19 
 
 
221 aa  270  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  60.19 
 
 
221 aa  270  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  39.2 
 
 
221 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  35.48 
 
 
226 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  36.73 
 
 
225 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1599  flagellar basal body rod modification protein  40.85 
 
 
270 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  36.82 
 
 
227 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  36.82 
 
 
237 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  36.77 
 
 
226 aa  135  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1163  flagellar basal body rod modification protein  37.79 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  36.94 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1347  flagellar basal body rod modification protein  38.43 
 
 
260 aa  132  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.796846  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  37.56 
 
 
282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1305  flagellar basal body rod modification protein  39.17 
 
 
263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  37.14 
 
 
238 aa  132  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  36.77 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  41.54 
 
 
236 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2595  flagellar basal body rod modification protein  38.35 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  35.65 
 
 
225 aa  128  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  35.65 
 
 
225 aa  128  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  38.94 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1331  flagellar basal body rod modification protein  36.57 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  35.21 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  35.79 
 
 
229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1342  flagellar basal body rod modification protein  37.04 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3098  flagellar basal body rod modification protein  35.78 
 
 
228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085236  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  35.35 
 
 
222 aa  126  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  35.68 
 
 
235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3098  flagellar basal body rod modification protein  40.53 
 
 
256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2960  flagellar basal body rod modification protein  40.53 
 
 
256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198197  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  36.54 
 
 
293 aa  125  7e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1418  flagellar basal body rod modification protein  40.53 
 
 
256 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1261  flagellar basal body rod modification protein  36.95 
 
 
256 aa  124  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2316  flagellar basal body rod modification protein  39.22 
 
 
242 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.383064 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1323  flagellar basal body rod modification protein  36.99 
 
 
259 aa  122  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  38.89 
 
 
235 aa  122  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2945  flagellar basal body rod modification protein  37.89 
 
 
256 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01288  flagellar basal body rod modification protein  41.58 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3248  flagellar basal body rod modification protein  36.41 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  38.37 
 
 
229 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02926  flagellar basal body rod modification protein  36.36 
 
 
228 aa  119  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  35.6 
 
 
229 aa  118  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  39.09 
 
 
236 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  38.59 
 
 
226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  37.91 
 
 
223 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  36.51 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  33.18 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  36.27 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  33.17 
 
 
233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  35.53 
 
 
278 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  37.91 
 
 
223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  35.24 
 
 
221 aa  112  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  33.01 
 
 
248 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  33.01 
 
 
248 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  34.23 
 
 
228 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  33.71 
 
 
251 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  34.2 
 
 
224 aa  108  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  33.49 
 
 
224 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  35.05 
 
 
228 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  34.81 
 
 
247 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  33.85 
 
 
280 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  33.85 
 
 
280 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  33.85 
 
 
280 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  34.29 
 
 
248 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  37.16 
 
 
225 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  33.62 
 
 
232 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  34.83 
 
 
231 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  34.83 
 
 
231 aa  105  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  37.16 
 
 
225 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  34.83 
 
 
231 aa  105  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  34.83 
 
 
231 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  33.62 
 
 
232 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  33.62 
 
 
232 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  33.62 
 
 
232 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  33.62 
 
 
232 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  33.15 
 
 
248 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  33.15 
 
 
248 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  34.33 
 
 
231 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  34.33 
 
 
231 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  34.83 
 
 
231 aa  105  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  38.24 
 
 
225 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  32.64 
 
 
233 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  34.83 
 
 
231 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  34.5 
 
 
225 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  34.42 
 
 
277 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  34.42 
 
 
277 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  34.42 
 
 
277 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  34.42 
 
 
277 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  34 
 
 
228 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  36.46 
 
 
225 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  35.51 
 
 
225 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  34 
 
 
228 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  39.62 
 
 
220 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  32.99 
 
 
222 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  37.22 
 
 
222 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3071  flagellar hook capping protein  40.37 
 
 
217 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.113202 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1479  basal-body rod modification protein FlgD  34 
 
 
256 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  35.52 
 
 
216 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  34.33 
 
 
231 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>