246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1472 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1472  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 227 aa  457  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  34.39 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  33.96 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  33.96 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  31.09 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  32.58 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  32.13 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  32.13 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  33.51 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  32.85 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  32.85 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  33.49 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  32.54 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  30.81 
 
 		 280 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  30.81 
 
 		 278 aa  99.4  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  30.81 
 
 		 280 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  30.81 
 
 		 280 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  30 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  31.68 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  33.51 
 
 		 224 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  30.5 
 
 		 277 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  30.5 
 
 		 277 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  30.5 
 
 		 277 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  30.5 
 
 		 277 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  32.32 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  34.02 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1479  basal-body rod modification protein FlgD  28.57 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  28.27 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  31.88 
 
 		 265 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  31.19 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  31.19 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  32.29 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  31.63 
 
 		 263 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01288  flagellar basal body rod modification protein  29.82 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  29.05 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  31.33 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  32.14 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  30.59 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  34.34 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  29.22 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  30.22 
 
 		 225 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  32.98 
 
 		 227 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  27.47 
 
 		 221 aa  89.4  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  33.16 
 
 		 218 aa  89  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  32.98 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  30.61 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  30.22 
 
 		 225 aa  88.6  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  32.45 
 
 		 218 aa  88.2  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  33.77 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  31.44 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  31.92 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  33.15 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  33.16 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02926  flagellar basal body rod modification protein  29.41 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  29.15 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  32.61 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  31.96 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  31.96 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  30.93 
 
 		 240 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  31.47 
 
 		 245 aa  85.5  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  29.74 
 
 		 228 aa  85.1  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1347  flagellar basal body rod modification protein  32.04 
 
 		 260 aa  85.5  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.796846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  33.54 
 
 		 232 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  33.54 
 
 		 232 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  33.54 
 
 		 232 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  33.54 
 
 		 232 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  33.54 
 
 		 232 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  27.23 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3098  flagellar basal body rod modification protein  31.22 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2960  flagellar basal body rod modification protein  31.22 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198197  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  30.04 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1305  flagellar basal body rod modification protein  31.84 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  33.01 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  27.4 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  31.82 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  31.82 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  31.42 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  28.31 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1418  flagellar basal body rod modification protein  31.22 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  31.82 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  27.06 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  30.05 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1331  flagellar basal body rod modification protein  30.24 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2945  flagellar basal body rod modification protein  31.55 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3098  flagellar basal body rod modification protein  29.7 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  29.13 
 
 		 284 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  32.24 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  30.81 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  30.93 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1163  flagellar basal body rod modification protein  30.81 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  30.39 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  28.23 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  27.23 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  32.03 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  28.77 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2595  flagellar basal body rod modification protein  30.1 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  32.24 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  32.24 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  32.24 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>