243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0274 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 
129 aa  255  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  63.89 
 
 
138 aa  153  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  60.55 
 
 
136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  61.47 
 
 
137 aa  142  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  61.47 
 
 
137 aa  142  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1702  flagellar basal body rod modification protein  57.94 
 
 
139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  52.07 
 
 
190 aa  134  4e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0662  flagellar basal body rod modification protein  54.63 
 
 
138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.25613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0699  flagellar basal body rod modification protein  54.81 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608637  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0688  flagellar basal body rod modification protein  54.81 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136658  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6511  flagellar basal body rod modification protein  49.17 
 
 
142 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0375  flagellar basal body rod modification protein  48.62 
 
 
144 aa  123  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118719  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3552  flagellar basal body rod modification protein  56.36 
 
 
141 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0769  flagellar basal body rod modification protein  50 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0343  flagellar basal body rod modification protein  46.88 
 
 
147 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.644683 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0047  flagellar basal body rod modification protein  48.62 
 
 
135 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1116  flagellar basal body rod modification protein  48.65 
 
 
135 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2595  flagellar basal body rod modification protein  47.83 
 
 
218 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.613344  hitchhiker  0.000000237471 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1336  flagellar basal body rod modification protein  46.94 
 
 
222 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0005  flagellar basal body rod modification protein  46.94 
 
 
222 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2978  flagellar basal body rod modification protein  48.72 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150885  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  50 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4207  flagellar basal body rod modification protein  48.24 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  31.37 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0777  flagellar hook capping protein  44.83 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0403278  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  37.84 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0415  flagellar hook capping protein  36.79 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2277  flagellar hook capping protein  34.62 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  42.7 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  34.04 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3365  flagellar basal body rod modification protein  43.43 
 
 
220 aa  67  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0113  flagellar hook capping protein  43.06 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  41.67 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  35.58 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 
140 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  47.3 
 
 
227 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  47.3 
 
 
237 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  42.55 
 
 
226 aa  62  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  40.54 
 
 
263 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  41.03 
 
 
131 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1623  flagellar basal body rod modification protein  42.86 
 
 
221 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2710  flagellar hook capping protein  41.03 
 
 
275 aa  61.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2340  flagellar hook capping protein  36.45 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  42.5 
 
 
226 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  41.24 
 
 
225 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  41.24 
 
 
225 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  41.24 
 
 
225 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1759  flagellar hook capping protein  34.95 
 
 
134 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31150  flagellar hook capping protein  33.91 
 
 
186 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0120404  normal  0.0821325 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0848  flagellar hook capping protein  36.08 
 
 
144 aa  60.5  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.538415  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  35.29 
 
 
284 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  37.21 
 
 
222 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  41.54 
 
 
221 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0067  flagellar hook capping protein  34.13 
 
 
221 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  36.63 
 
 
233 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2038  flagellar hook capping protein  32.28 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0059  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0856  flagellar hook capping protein-like protein  27.27 
 
 
180 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2166  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  45.45 
 
 
221 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  41.25 
 
 
223 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2769  flagellar basal body rod modification protein  39.47 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.225291  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  30 
 
 
218 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3466  flagellar hook capping protein  32.8 
 
 
220 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  39.47 
 
 
263 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3102  flagellar hook capping protein  28.87 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0961418  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  35.87 
 
 
215 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  35.87 
 
 
215 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 
220 aa  57.8  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  38.24 
 
 
238 aa  57.4  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  32.93 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3571  flagellar hook capping protein  42.65 
 
 
224 aa  57  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3576  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 
230 aa  57  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  30.63 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  40 
 
 
222 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  41.67 
 
 
229 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  37.5 
 
 
234 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3649  flagellar hook capping protein  67.65 
 
 
220 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1502  flagellar hook capping protein  51.06 
 
 
263 aa  56.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  40.91 
 
 
221 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  36.49 
 
 
218 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 
248 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  40.91 
 
 
221 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  37.63 
 
 
175 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0073  flagellar hook capping protein  30.43 
 
 
219 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0752  flagellar hook capping protein  31.73 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.966929  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0971  flagellar hook capping protein  38.81 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  42.31 
 
 
221 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  31.07 
 
 
245 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  32.56 
 
 
226 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  37.23 
 
 
233 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  38.71 
 
 
223 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  38.18 
 
 
237 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  41.77 
 
 
240 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 
248 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 
248 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  31.78 
 
 
265 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  42.31 
 
 
240 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  38.71 
 
 
223 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.751206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>