257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0343 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0343  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 
147 aa  286  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.644683 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0375  flagellar basal body rod modification protein  92.25 
 
 
144 aa  239  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118719  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  54.13 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  46.88 
 
 
129 aa  126  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1702  flagellar basal body rod modification protein  55.14 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  48.36 
 
 
190 aa  125  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0662  flagellar basal body rod modification protein  52.78 
 
 
138 aa  124  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.25613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3552  flagellar basal body rod modification protein  53.64 
 
 
141 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0699  flagellar basal body rod modification protein  50.93 
 
 
138 aa  121  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608637  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0688  flagellar basal body rod modification protein  50.93 
 
 
138 aa  121  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136658  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  45.05 
 
 
136 aa  121  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  44.14 
 
 
137 aa  117  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  44.14 
 
 
137 aa  117  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0769  flagellar basal body rod modification protein  51.43 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6511  flagellar basal body rod modification protein  47.71 
 
 
142 aa  110  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1116  flagellar basal body rod modification protein  48.65 
 
 
135 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0047  flagellar basal body rod modification protein  49.07 
 
 
135 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  39.13 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  41.58 
 
 
245 aa  72  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2277  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0472  flagellar hook capping protein  36.24 
 
 
323 aa  70.5  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  41.94 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  40.86 
 
 
237 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  35.05 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  45.68 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  38.82 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0048  flagellar hook capping protein  35.71 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  37.72 
 
 
245 aa  64.7  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  35.85 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0113  flagellar hook capping protein  50.75 
 
 
253 aa  64.3  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  45.31 
 
 
221 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  45.24 
 
 
242 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0073  flagellar hook capping protein  37.38 
 
 
219 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  43.48 
 
 
221 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  41.1 
 
 
221 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  31.68 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  40.54 
 
 
228 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4207  flagellar basal body rod modification protein  41.38 
 
 
221 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  39.74 
 
 
226 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  48.48 
 
 
222 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1336  flagellar basal body rod modification protein  34 
 
 
222 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  41.1 
 
 
221 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0005  flagellar basal body rod modification protein  34 
 
 
222 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  38.04 
 
 
215 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  44.23 
 
 
229 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  38.04 
 
 
215 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  42.03 
 
 
218 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  48.15 
 
 
226 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  48.15 
 
 
226 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1502  flagellar hook capping protein  34.96 
 
 
263 aa  60.8  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  48.15 
 
 
223 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  41.33 
 
 
228 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  46.97 
 
 
221 aa  60.5  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2038  flagellar hook capping protein  33.62 
 
 
136 aa  60.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  38.71 
 
 
159 aa  60.1  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  38.32 
 
 
235 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2978  flagellar basal body rod modification protein  42.11 
 
 
231 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150885  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  36.84 
 
 
284 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  40.85 
 
 
265 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  48.48 
 
 
228 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  51.43 
 
 
229 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1759  flagellar hook capping protein  31 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2710  flagellar hook capping protein  42.17 
 
 
275 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  41.86 
 
 
234 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3365  flagellar basal body rod modification protein  43.28 
 
 
220 aa  58.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  38.46 
 
 
278 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  46.15 
 
 
240 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2166  flagellar hook capping protein  32.58 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  41 
 
 
233 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  34.21 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  46.15 
 
 
240 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0059  flagellar hook capping protein  40.28 
 
 
135 aa  57.8  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  45.95 
 
 
220 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  48.44 
 
 
237 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  38.61 
 
 
280 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  34.48 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  38.61 
 
 
277 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  38.61 
 
 
280 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  38.61 
 
 
277 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  38.61 
 
 
277 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  38.61 
 
 
280 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  38.61 
 
 
277 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  32.17 
 
 
175 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  30.19 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0067  flagellar hook capping protein  36.59 
 
 
221 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0415  flagellar hook capping protein  27.61 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2533  flagellar hook capping protein  44.44 
 
 
229 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0777  flagellar hook capping protein  35.79 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0403278  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3649  flagellar hook capping protein  40.91 
 
 
220 aa  56.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2595  flagellar basal body rod modification protein  32.95 
 
 
218 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.613344  hitchhiker  0.000000237471 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3466  flagellar hook capping protein  41.18 
 
 
220 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  32.11 
 
 
226 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  44.19 
 
 
225 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000738  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  31.25 
 
 
227 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  40.54 
 
 
221 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  42.47 
 
 
247 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0144  flagellar hook capping protein  32.98 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  44.19 
 
 
225 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  42.86 
 
 
248 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3969  flagellar hook capping protein  41.18 
 
 
220 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>