211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3365 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3365  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 		 220 aa  442  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2595  flagellar basal body rod modification protein  45.93 
 
 		 218 aa  184  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.613344  hitchhiker  0.000000237471 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0005  flagellar basal body rod modification protein  43.87 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1336  flagellar basal body rod modification protein  43.4 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2978  flagellar basal body rod modification protein  41 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150885  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4207  flagellar basal body rod modification protein  40.5 
 
 		 221 aa  151  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1623  flagellar basal body rod modification protein  38.01 
 
 		 221 aa  121  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  33.49 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  37.43 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  36.87 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  36.31 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2533  flagellar hook capping protein  28.57 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0689  flagellar hook capping protein  32.54 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.603097  normal  0.525021 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  34.87 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  30.35 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  32.8 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  30.14 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  30.39 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  30.39 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01288  flagellar basal body rod modification protein  33.14 
 
 		 235 aa  72  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3571  flagellar hook capping protein  36.64 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  32.54 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  32.64 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  28.49 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  29.15 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  31.41 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7244  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  30.32 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  32.1 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  28.26 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  31.5 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  31.5 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  43.43 
 
 		 129 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  28.14 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  30.67 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  28.75 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1976  flagellar basal body rod modification protein  27.42 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  31.69 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  30.32 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  28.64 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  28.64 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0113  flagellar hook capping protein  28.57 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  31.28 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  31.01 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  31.01 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  31.65 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  29.83 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  31.01 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  31.01 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  31.01 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  30.52 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  31.01 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  31.61 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  32.89 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  28.57 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  28.08 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  30.81 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  31.21 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  46.27 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  46.27 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  46.27 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  29.7 
 
 		 226 aa  62  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  25.91 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  26.53 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  26.53 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  26.53 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  26.53 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  26.53 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  30.9 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  32.68 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  43.96 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  29.45 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  31.53 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  27.16 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  31.08 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  27.15 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  25.64 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0375  flagellar basal body rod modification protein  43.28 
 
 		 144 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  29.79 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  28.57 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  30.69 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1479  basal-body rod modification protein FlgD  28.93 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  35.71 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  32.5 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1472  flagellar hook capping protein  31.21 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  28.07 
 
 		 282 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  29.93 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  31.08 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1261  flagellar basal body rod modification protein  28.75 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1331  flagellar basal body rod modification protein  28.75 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  23.2 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  30.14 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  29.53 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  27.98 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  31.08 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  25.12 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  37.84 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  25.12 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>