228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7244 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7244  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  100 
 
 		 235 aa  477  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1494  flagellar hook capping protein  50.47 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0985  flagellar hook capping protein  56.63 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1878  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  51.41 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3964  flagellar hook capping protein  52.48 
 
 		 242 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4118  flagellar hook capping protein  54.5 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  48.34 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0601  flagellar hook capping protein  46.89 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.366943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  46.4 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0693  flagellar hook capping protein  48.02 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  44.5 
 
 		 223 aa  158  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  44.1 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  44.1 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  44.67 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  38.22 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0689  flagellar hook capping protein  35.61 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.603097  normal  0.525021 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2533  flagellar hook capping protein  34.74 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  34.93 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  33.16 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0113  flagellar hook capping protein  30.93 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  29.95 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  31.75 
 
 		 227 aa  96.3  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  33.94 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  32.11 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  34.62 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  32.08 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  32.11 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  31.79 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  37 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  31.05 
 
 		 220 aa  88.6  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  29.73 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  33.5 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  30.46 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  30.61 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  31.58 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3571  flagellar hook capping protein  31.94 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  34.32 
 
 		 224 aa  85.1  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  30.92 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  31.09 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  29.3 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  34.34 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  27.37 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  30.96 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  32.99 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  29.21 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  32.12 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0764  flagellar hook capping protein  32.28 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  27.69 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  30.24 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0870  flagellar hook capping protein  34.46 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  31.61 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  35.92 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3456  flagellar hook capping protein  32.8 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.290459  normal  0.317181 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  31.12 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  31.43 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  30.81 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  32.5 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  30.32 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  29.95 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  28.04 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2978  flagellar basal body rod modification protein  29.48 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150885  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  28.04 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  30.86 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  28.8 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  31.82 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  31.61 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  32.6 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  32.84 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  32.84 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  29.7 
 
 		 284 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  26.9 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  31.67 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  31.55 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  34.67 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  31.55 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  31.55 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  31.55 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  31.55 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  32.99 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  26.53 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  32.16 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  31.32 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  32.99 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  28.22 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01288  flagellar basal body rod modification protein  36.05 
 
 		 235 aa  72  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  31.9 
 
 		 231 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  27.78 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  31.9 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4207  flagellar basal body rod modification protein  34.57 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3164  putative basal-body rod modification protein flgD  27.68 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562782  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  24.75 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2595  flagellar basal body rod modification protein  29.56 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.613344  hitchhiker  0.000000237471 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  31.9 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  31.43 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  26.02 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1336  flagellar basal body rod modification protein  30.3 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  31.43 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  31.43 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  31.43 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0030  flagellar hook capping protein  25.93 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>