253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_16820 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  100 
 
 
142 aa  294  3e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0856  flagellar hook capping protein-like protein  39.57 
 
 
180 aa  99  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  42.11 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  40.98 
 
 
142 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  35.97 
 
 
134 aa  89.4  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  40.91 
 
 
284 aa  88.6  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  40.16 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  48.28 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0472  flagellar hook capping protein  41.32 
 
 
323 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1502  flagellar hook capping protein  48.15 
 
 
263 aa  85.9  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2166  flagellar hook capping protein  37.72 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  43.48 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2044  flagellar hook capping protein  54.17 
 
 
285 aa  82  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1702  flagellar basal body rod modification protein  40.4 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  48.68 
 
 
218 aa  80.9  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  38.61 
 
 
185 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  44.19 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  39.05 
 
 
265 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2769  flagellar basal body rod modification protein  52.17 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.225291  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  37 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  37 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  43.75 
 
 
235 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  61.4 
 
 
226 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3552  flagellar basal body rod modification protein  34.95 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  37.5 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  45.45 
 
 
263 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  41.3 
 
 
225 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  45.57 
 
 
221 aa  77  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  41.3 
 
 
225 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  41.25 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  41.3 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  36 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0059  flagellar hook capping protein  43.82 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  44.59 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2277  flagellar hook capping protein  40.45 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  46.05 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0752  flagellar hook capping protein  32.48 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.966929  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  44.59 
 
 
233 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0415  flagellar hook capping protein  37.74 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  41.57 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  41.98 
 
 
242 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  39.56 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  39.56 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  41.24 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1398  flagellar hook capping protein  39 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.350528  normal  0.988245 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  36.13 
 
 
238 aa  72  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1116  flagellar basal body rod modification protein  35.51 
 
 
135 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  43.04 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  37.93 
 
 
229 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  38.78 
 
 
222 aa  70.9  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2020  flagellar hook capping protein  30.41 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.292444  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  43.84 
 
 
237 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2984  flagellar hook capping protein  31.67 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0662  flagellar basal body rod modification protein  36.78 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.25613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6511  flagellar basal body rod modification protein  39.77 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  43.84 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2038  flagellar hook capping protein  36.08 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0777  flagellar hook capping protein  43.82 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0403278  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  37.36 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  42.67 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2340  flagellar hook capping protein  31.3 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  42.86 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0699  flagellar basal body rod modification protein  33.04 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608637  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0688  flagellar basal body rod modification protein  33.04 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136658  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  36.47 
 
 
245 aa  67.4  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  37.62 
 
 
159 aa  67  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  39.73 
 
 
227 aa  67  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  41.67 
 
 
225 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  41.18 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  42.5 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  35.82 
 
 
221 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  38.2 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  38.2 
 
 
224 aa  64.7  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0048  flagellar hook capping protein  35.71 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  40 
 
 
221 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  42.55 
 
 
227 aa  64.3  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  34.69 
 
 
245 aa  63.9  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2316  flagellar basal body rod modification protein  41.98 
 
 
242 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.383064 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0047  flagellar basal body rod modification protein  33.63 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0375  flagellar basal body rod modification protein  34 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118719  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1163  flagellar basal body rod modification protein  40.74 
 
 
261 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  42.47 
 
 
221 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  43.48 
 
 
228 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2978  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 
231 aa  62  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150885  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31150  flagellar hook capping protein  26.55 
 
 
186 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0120404  normal  0.0821325 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0848  flagellar hook capping protein  37.35 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.538415  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  39.73 
 
 
223 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2945  flagellar basal body rod modification protein  34.58 
 
 
256 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  29.9 
 
 
215 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  42.03 
 
 
221 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  53.06 
 
 
218 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1261  flagellar basal body rod modification protein  35.19 
 
 
256 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1331  flagellar basal body rod modification protein  35.19 
 
 
256 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  41.1 
 
 
223 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  29.9 
 
 
215 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  39.73 
 
 
223 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3969  flagellar hook capping protein  40.43 
 
 
220 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1347  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 
260 aa  61.2  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.796846  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  40.28 
 
 
226 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>