258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0247 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 263 aa  531  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  53.91 
 
 		 265 aa  242  5e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  53.36 
 
 		 263 aa  238  8e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  47.95 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  37.55 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  35.47 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  34.62 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  35.04 
 
 		 225 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  34.62 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  37.07 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  36.22 
 
 		 218 aa  110  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  34.01 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  34.9 
 
 		 221 aa  107  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  34.47 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  36.51 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  35.44 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  31.92 
 
 		 234 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  32.86 
 
 		 242 aa  102  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  33.01 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  32.02 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  33.19 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  33.18 
 
 		 221 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  31.07 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  33.5 
 
 		 233 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  33.18 
 
 		 247 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 280 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  31.9 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 280 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  29.9 
 
 		 221 aa  97.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  33.52 
 
 		 224 aa  97.1  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  33.01 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  33.01 
 
 		 280 aa  95.1  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  32.97 
 
 		 224 aa  95.1  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  31.96 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  32.37 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  31.22 
 
 		 234 aa  92.4  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  32.37 
 
 		 227 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  31.55 
 
 		 233 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  29.91 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  32.85 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  32.85 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  32.85 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  32.85 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  33.52 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  30.05 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  31.1 
 
 		 248 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  30.35 
 
 		 228 aa  89  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  32.56 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  32.56 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 227 aa  88.6  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  31.1 
 
 		 248 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  31.16 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  27.94 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  28.86 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  30.69 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  30.69 
 
 		 226 aa  87  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2978  flagellar basal body rod modification protein  30.45 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150885  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  31.58 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  31.96 
 
 		 221 aa  86.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  29.41 
 
 		 225 aa  85.9  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  29.51 
 
 		 226 aa  85.9  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  31.71 
 
 		 228 aa  85.5  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  31.71 
 
 		 228 aa  85.5  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  30.05 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  28.23 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  30.05 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  32.56 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  31.29 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  29.56 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  29.56 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  32.18 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  30.73 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  29.27 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0030  flagellar hook capping protein  30.58 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  31.53 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  26.18 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  32.5 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  31.03 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2048  flagellar basal body rod modification protein  30.62 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.854141  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  30.1 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  30.35 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  31.98 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2044  flagellar hook capping protein  46.08 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  30.3 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  30.15 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  31.52 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  32.61 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  50 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  31.52 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  31.52 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  31.52 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1599  flagellar basal body rod modification protein  28.57 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  31.52 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0041  flagellar basal body rod modification protein  30.56 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  28.44 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0080  flagellar basal body rod modification protein  30.56 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0009  flagellar basal body rod modification protein  28.64 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  31.68 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>