258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0547 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  100 
 
 
245 aa  490  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  40.41 
 
 
228 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  36.65 
 
 
232 aa  122  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  38.76 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  39.27 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  40.37 
 
 
233 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0113  flagellar hook capping protein  37.56 
 
 
253 aa  118  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  36 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  38.34 
 
 
222 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  37.37 
 
 
221 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0689  flagellar hook capping protein  34.88 
 
 
221 aa  113  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.603097  normal  0.525021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0764  flagellar hook capping protein  39.58 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  36.87 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  36.27 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0870  flagellar hook capping protein  38.95 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  38.42 
 
 
218 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  45.21 
 
 
228 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  35.75 
 
 
218 aa  105  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3164  putative basal-body rod modification protein flgD  39.07 
 
 
221 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562782  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  35.5 
 
 
218 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  34.13 
 
 
225 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  35.26 
 
 
225 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  34.13 
 
 
225 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  35.71 
 
 
223 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  37.84 
 
 
215 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  37.84 
 
 
215 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2978  flagellar basal body rod modification protein  33.69 
 
 
231 aa  99.4  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150885  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  34.71 
 
 
229 aa  98.6  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  39.44 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  39.44 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  34.1 
 
 
226 aa  95.5  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  39.56 
 
 
221 aa  95.5  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  32.45 
 
 
227 aa  95.1  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  32.9 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  32.84 
 
 
220 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  29.09 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  33.15 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  33.19 
 
 
237 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  33.19 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4207  flagellar basal body rod modification protein  34.07 
 
 
221 aa  89.4  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  33.52 
 
 
263 aa  89.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2533  flagellar hook capping protein  33.54 
 
 
229 aa  89  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3456  flagellar hook capping protein  35.22 
 
 
258 aa  89  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.290459  normal  0.317181 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  31.74 
 
 
265 aa  89  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  35.52 
 
 
232 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  35.52 
 
 
232 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  35.52 
 
 
232 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  35.52 
 
 
232 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  35.52 
 
 
232 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  30.06 
 
 
218 aa  88.2  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  36.18 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7244  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  30.26 
 
 
235 aa  86.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1336  flagellar basal body rod modification protein  35.03 
 
 
222 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2595  flagellar basal body rod modification protein  34.13 
 
 
218 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.613344  hitchhiker  0.000000237471 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  32.98 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  34.73 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  37.5 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  37.5 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0005  flagellar basal body rod modification protein  35.19 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  36.88 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  33.81 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  32.99 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  34.95 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  37.11 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  35.03 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  37.11 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  37.11 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  35.03 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  35.03 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  35.03 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  36.48 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  36.48 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  30.05 
 
 
222 aa  82  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  29.56 
 
 
234 aa  82  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  30.54 
 
 
224 aa  82  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  36.88 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  41.35 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  35.93 
 
 
228 aa  82  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  35.68 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  32.7 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3571  flagellar hook capping protein  33.67 
 
 
224 aa  81.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  30.26 
 
 
234 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  30.73 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  35.68 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  32.06 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  35.68 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  35.33 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  31.72 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  35.33 
 
 
225 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  30.15 
 
 
222 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  35.37 
 
 
221 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  32.7 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  34.67 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2048  flagellar basal body rod modification protein  31.33 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.854141  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  31.58 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  34.04 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  31.63 
 
 
282 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  31.58 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  33.18 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.766915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>