248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0415 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0415  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  42.57 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  37.29 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  48.72 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  43.69 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  37.74 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2277  flagellar hook capping protein  39.82 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0856  flagellar hook capping protein-like protein  33.33 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0752  flagellar hook capping protein  35.29 
 
 		 163 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.966929  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  44.74 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  44.74 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  39.86 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  43.82 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1398  flagellar hook capping protein  29.1 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.350528  normal  0.988245 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0777  flagellar hook capping protein  41.67 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0403278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  33.94 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2340  flagellar hook capping protein  37.38 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  34.58 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  36.04 
 
 		 185 aa  70.5  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2769  flagellar basal body rod modification protein  39.34 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.225291  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2020  flagellar hook capping protein  33.6 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.292444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  36.79 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  35.11 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  39.09 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  40.24 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31150  flagellar hook capping protein  30.65 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0120404  normal  0.0821325 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  40.24 
 
 		 225 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  40.24 
 
 		 225 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  37.98 
 
 		 226 aa  67  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  35.51 
 
 		 184 aa  67  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  39.25 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  33.82 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1502  flagellar hook capping protein  36.63 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  42.11 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0472  flagellar hook capping protein  39.42 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2038  flagellar hook capping protein  31.82 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  35.66 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3102  flagellar hook capping protein  33.02 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0961418  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  35.66 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  36.79 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  43.66 
 
 		 265 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  33.87 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  37.5 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  34.71 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  39.13 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0848  flagellar hook capping protein  35.65 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.538415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  46.88 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  35.56 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2984  flagellar hook capping protein  29.91 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2166  flagellar hook capping protein  43.06 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  46.88 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  38.16 
 
 		 218 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  35.56 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  35.56 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3571  flagellar hook capping protein  40.85 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2044  flagellar hook capping protein  43.66 
 
 		 285 aa  60.8  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  31.69 
 
 		 245 aa  60.5  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  52.94 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  38.16 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0721  flagellar basal body rod modification protein  35.56 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1116  flagellar basal body rod modification protein  35.56 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0059  flagellar hook capping protein  33.64 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0225  flagellar basal body rod modification protein  35.56 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0144  flagellar hook capping protein  30.43 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1702  flagellar basal body rod modification protein  35.63 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0769  flagellar basal body rod modification protein  38.3 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  48 
 
 		 223 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  33.94 
 
 		 218 aa  57.4  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0048  flagellar hook capping protein  35.09 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  41.67 
 
 		 236 aa  57  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  36.36 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  32.12 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6511  flagellar basal body rod modification protein  33 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0113  flagellar hook capping protein  39.44 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2595  flagellar basal body rod modification protein  34.95 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.613344  hitchhiker  0.000000237471 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2710  flagellar hook capping protein  30.08 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  37.88 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1336  flagellar basal body rod modification protein  34.38 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  36.71 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0641  flagellar basal body rod modification protein  36.52 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0005  flagellar basal body rod modification protein  34.38 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  32.99 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1163  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04911  flagellar basal body rod modification protein  31.62 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  37.33 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0971  flagellar hook capping protein  35.42 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  39.47 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  44.9 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  36.25 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  41.89 
 
 		 236 aa  54.3  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  41.89 
 
 		 245 aa  54.3  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  36.9 
 
 		 227 aa  53.9  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3576  flagellar basal body rod modification protein  32.91 
 
 		 230 aa  53.9  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1567  flagellar basal body rod modification protein  29.13 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1540  flagellar basal body rod modification protein  29.13 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1529  flagellar basal body rod modification protein  29.13 
 
 		 190 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  30.68 
 
 		 282 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  40.54 
 
 		 235 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1750  flagellar basal body rod modification protein  29.13 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1261  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 256 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>