229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0641 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0641  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 		 218 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0225  flagellar basal body rod modification protein  96.33 
 
 		 218 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0721  flagellar basal body rod modification protein  95.41 
 
 		 218 aa  410  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0208  flagellar basal body rod modification protein  49.47 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.577619 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04911  flagellar basal body rod modification protein  45.79 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3576  flagellar basal body rod modification protein  44.04 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3369  flagellar hook capping protein  40.62 
 
 		 237 aa  162  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0265  lateral flagellar rod protein LfgD  40.62 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000738  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  43.16 
 
 		 227 aa  158  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4673  flagellar basal body rod modification protein  36.62 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795242 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3969  flagellar hook capping protein  37.21 
 
 		 220 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0067  flagellar hook capping protein  33.48 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0073  flagellar hook capping protein  36.53 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0186  flagellar basal body rod modification protein  35.87 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3649  flagellar hook capping protein  34.83 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0239  flagellar basal body rod modification protein  35.33 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3466  flagellar hook capping protein  32.68 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  39 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  33.66 
 
 		 242 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  30.91 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  32.14 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  29.52 
 
 		 237 aa  92  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  34.18 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  33.13 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  30.93 
 
 		 234 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  32.65 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  29 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  29.65 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  28.87 
 
 		 293 aa  85.5  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  35.45 
 
 		 225 aa  85.1  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  32.32 
 
 		 229 aa  84.7  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  35.26 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  29.95 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  33.69 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  30.77 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  30.21 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  31.63 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  34.74 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  34.74 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  31.02 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  32.62 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  28.72 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  30.15 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3716  flagellar hook capping protein  29.89 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  30.47 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  35.67 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251185 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  34.12 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  34.12 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  34.12 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  34.12 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  30.5 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  34.12 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  30.37 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  34.12 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  30.5 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  34.12 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  37.04 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0567  flagellar hook capping protein  31.02 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  30.37 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  30.37 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  27.41 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  31.11 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  29.84 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  31.58 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  31.58 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2732  flagellar hook capping protein  27.98 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000455072 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  31.58 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  31.58 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  31.58 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  34.13 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  36.73 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  33.7 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  32.04 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1479  basal-body rod modification protein FlgD  28.57 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  36.73 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  32.24 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  31.28 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  27.4 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  30.98 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  33.78 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  33.85 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0764  flagellar hook capping protein  29.61 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02926  flagellar basal body rod modification protein  26.67 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  27.67 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  32.32 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3829  flagellar hook capping protein  25.27 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3102  flagellar hook capping protein  25.27 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.576147  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0870  flagellar hook capping protein  29.78 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1589  flagellar basal body rod modification protein  34.06 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  30.6 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  30.6 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  27.06 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  30.24 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2316  flagellar basal body rod modification protein  27.75 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.383064 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  30.1 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  27.32 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  28.95 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  32.14 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  33.59 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>