228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0764 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0764  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 220 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0870  flagellar hook capping protein  72.73 
 
 		 218 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  60.73 
 
 		 222 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3164  putative basal-body rod modification protein flgD  60.21 
 
 		 221 aa  214  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562782  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  39.9 
 
 		 223 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  37.79 
 
 		 233 aa  121  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  39.9 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  38.31 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  38.71 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  40.12 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  38.07 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  34.87 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  38.86 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  35.4 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  37.76 
 
 		 221 aa  104  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  37.24 
 
 		 221 aa  104  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  33.85 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  35.47 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  37.02 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0689  flagellar hook capping protein  31.92 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.603097  normal  0.525021 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  36.84 
 
 		 229 aa  98.2  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  32.2 
 
 		 225 aa  98.2  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  32.2 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  32.2 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  37.16 
 
 		 222 aa  95.5  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  31.78 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  30.93 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  32.65 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2533  flagellar hook capping protein  33.69 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  29.47 
 
 		 265 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  33.17 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7244  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  31.8 
 
 		 235 aa  91.7  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  30 
 
 		 230 aa  91.7  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  36.79 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  33.92 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  33.51 
 
 		 284 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  36.46 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  36.46 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  33.16 
 
 		 226 aa  88.6  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  32.06 
 
 		 234 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  30.64 
 
 		 263 aa  88.2  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  32.81 
 
 		 224 aa  88.2  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  31.46 
 
 		 224 aa  88.2  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4118  flagellar hook capping protein  37.43 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  32 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  35.67 
 
 		 220 aa  86.3  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  34.12 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0985  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459314 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3964  flagellar hook capping protein  34.27 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  29.05 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  35.29 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  31.91 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1494  flagellar hook capping protein  29.65 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  27.75 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  29.05 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  32.58 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1472  flagellar hook capping protein  32.53 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  31 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  30.38 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  32.12 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0693  flagellar hook capping protein  33.94 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  28.66 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  33.55 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3456  flagellar hook capping protein  38.56 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.290459  normal  0.317181 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  27.46 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0641  flagellar basal body rod modification protein  29.61 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1878  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  33.33 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  34.52 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  32.52 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  36.36 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  36.36 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  34.52 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  34.52 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  34.52 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0601  flagellar hook capping protein  32.32 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.366943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  34.17 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1976  flagellar basal body rod modification protein  33.17 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  34.17 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  34.17 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  32.39 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  32.39 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  32.39 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  32.39 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1639  flagellar hook capping protein  26.64 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.209665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  32.39 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  32.39 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  32.39 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0225  flagellar basal body rod modification protein  29.61 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  34.18 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  31.82 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  35.71 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4207  flagellar basal body rod modification protein  33.15 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  30.65 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  31.21 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  31.19 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  34.97 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0208  flagellar basal body rod modification protein  31.32 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.577619 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0113  flagellar hook capping protein  32.87 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>