235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0985 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0985  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459314 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3964  flagellar hook capping protein  62.71 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1494  flagellar hook capping protein  59.21 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1878  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  62.86 
 
 		 230 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0693  flagellar hook capping protein  62.86 
 
 		 230 aa  229  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7244  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  57.07 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4118  flagellar hook capping protein  62.75 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0601  flagellar hook capping protein  58.86 
 
 		 230 aa  221  7e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.366943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  44.06 
 
 		 228 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  47.18 
 
 		 233 aa  161  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  45.1 
 
 		 226 aa  161  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  45.1 
 
 		 226 aa  161  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  43.9 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  40.91 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  45 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  36.67 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0689  flagellar hook capping protein  37.63 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.603097  normal  0.525021 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2533  flagellar hook capping protein  34.52 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  36.06 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  36.6 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  35.45 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0113  flagellar hook capping protein  34.84 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  30.5 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  36.68 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0764  flagellar hook capping protein  35.98 
 
 		 220 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  32.84 
 
 		 221 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  38.19 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  31.94 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  32.68 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  30.61 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  33.73 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  33.99 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  32.12 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  36.3 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0870  flagellar hook capping protein  37.04 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  34.87 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  35 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  32.32 
 
 		 226 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  32.32 
 
 		 265 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  30.6 
 
 		 220 aa  89.4  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  33.5 
 
 		 218 aa  89  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  34.18 
 
 		 228 aa  88.6  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  28.57 
 
 		 225 aa  88.2  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  28.57 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  27.8 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  28.11 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  30.7 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  32.84 
 
 		 277 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  32.84 
 
 		 277 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  32.84 
 
 		 277 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  32.84 
 
 		 277 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  32.35 
 
 		 280 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  36.09 
 
 		 215 aa  85.5  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  32.35 
 
 		 278 aa  85.5  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  36.09 
 
 		 215 aa  85.5  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  32.35 
 
 		 280 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  32.35 
 
 		 280 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  29.88 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  31.86 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  32.6 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  33.84 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4207  flagellar basal body rod modification protein  32.97 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  32.49 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  33.84 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  31.67 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  31.48 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  28.77 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  31.05 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  31.96 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  31.96 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  33.89 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  31.96 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  31.96 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  31.96 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  33.88 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  32.32 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  29.41 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  29.3 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  28.64 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  33.7 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  30.51 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  29.19 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  33.16 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3164  putative basal-body rod modification protein flgD  32.58 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562782  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  35.98 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  33.16 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  30.58 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  29.21 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  34.19 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1589  flagellar basal body rod modification protein  31.86 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  34.19 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  34.19 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  36.17 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  34.19 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  34.19 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  34.19 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  34.19 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  34.19 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>