236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3164 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3164  putative basal-body rod modification protein flgD  100 
 
 		 221 aa  414  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562782  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  78.53 
 
 		 222 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0870  flagellar hook capping protein  63.87 
 
 		 218 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0764  flagellar hook capping protein  60.21 
 
 		 220 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  37.69 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  38.58 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  39.63 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  35.35 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  36.18 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  36.87 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  35.03 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  34.48 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  34.5 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  35.14 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  31.96 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  35.38 
 
 		 226 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  33.82 
 
 		 233 aa  101  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  36.32 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  34.3 
 
 		 232 aa  98.2  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  37.23 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  31.09 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  31.09 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  30.21 
 
 		 265 aa  95.1  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  38.64 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  38.64 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  31.96 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0689  flagellar hook capping protein  32.45 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.603097  normal  0.525021 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  34.29 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  29.63 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  32.14 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  35.93 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  34.56 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  34.44 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  31.87 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  42.67 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  31.09 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1639  flagellar hook capping protein  29.72 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.209665  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  31.98 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  33.14 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1472  flagellar hook capping protein  30.54 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  36.36 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  36.36 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  36.36 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  36.36 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  36.36 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  36.36 
 
 		 280 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  36.36 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  31.84 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7244  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  27.54 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  29.82 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  35.5 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  35.5 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  31.93 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  32.34 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  32.34 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  34.94 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  35.76 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4118  flagellar hook capping protein  35.09 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  36.63 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  35.5 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  35.33 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  29.12 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  29.71 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  34.55 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  29.65 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  32.26 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  32.26 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  31.67 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0030  flagellar hook capping protein  33.12 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  29.34 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  36.47 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  34.97 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  32.14 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  29.69 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  29.24 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  32.93 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  30.04 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  35.03 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1479  basal-body rod modification protein FlgD  29.59 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  30.5 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  32.45 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  36.36 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  30.77 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  32.14 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3716  flagellar hook capping protein  31.95 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  30.22 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  30.22 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  34.93 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  29.65 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  30.22 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  29.7 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  30.22 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3456  flagellar hook capping protein  35.9 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.290459  normal  0.317181 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  25.86 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  35.62 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3102  flagellar hook capping protein  32.31 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.576147  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  29.61 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3829  flagellar hook capping protein  32.31 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  30.22 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>