237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4118 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4118  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 233 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3964  flagellar hook capping protein  82.97 
 
 		 242 aa  346  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1494  flagellar hook capping protein  72.05 
 
 		 237 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0985  flagellar hook capping protein  58.72 
 
 		 237 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0693  flagellar hook capping protein  60.8 
 
 		 230 aa  218  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1878  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  59.43 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7244  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  53.88 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0601  flagellar hook capping protein  56.25 
 
 		 230 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.366943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  47.06 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  48.06 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  46.86 
 
 		 226 aa  168  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  46.86 
 
 		 226 aa  168  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  48.08 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  43.48 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  37.07 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  35.32 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  37.29 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2533  flagellar hook capping protein  33.85 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0689  flagellar hook capping protein  34.02 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.603097  normal  0.525021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0764  flagellar hook capping protein  38.42 
 
 		 220 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0113  flagellar hook capping protein  37.18 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  32.51 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  32.86 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0870  flagellar hook capping protein  42.13 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  32.67 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  37.95 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2978  flagellar basal body rod modification protein  33.75 
 
 		 231 aa  92.8  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150885  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  31.58 
 
 		 220 aa  92.4  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4207  flagellar basal body rod modification protein  37.65 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  34.43 
 
 		 221 aa  91.7  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  29.23 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  32.67 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  29.7 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  31.68 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  29.34 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  29.7 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  30.96 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  32.46 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  31.18 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3164  putative basal-body rod modification protein flgD  37.08 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562782  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  34.17 
 
 		 223 aa  86.3  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  29.12 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  34.44 
 
 		 245 aa  85.1  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  28.04 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  25.36 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3456  flagellar hook capping protein  38.69 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.290459  normal  0.317181 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  31.22 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  30.95 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  27.71 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3365  flagellar basal body rod modification protein  34.16 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  29.69 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  28.93 
 
 		 263 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  32.14 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  32.41 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2595  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.613344  hitchhiker  0.000000237471 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1336  flagellar basal body rod modification protein  32.05 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  29.53 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  31.21 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  30.14 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  29.31 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  32.67 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0005  flagellar basal body rod modification protein  32.05 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  31 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  32.67 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  32.16 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  35.1 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  32.5 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  26.63 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  30.21 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  32.95 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  32.57 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  35.64 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  29.53 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  35.64 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  27.57 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1472  flagellar hook capping protein  32.14 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  29.53 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  27.27 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  33.65 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  29.23 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  30 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  33.65 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  33.65 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  31.56 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  31.56 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  31.56 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  31.56 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  31.56 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  35.88 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  35.66 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  33.49 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  35.88 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  35.88 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  36.3 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  25.12 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  33.49 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  35.88 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  35.88 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  35.88 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  35.88 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>