239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0601 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0601  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 230 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.366943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0693  flagellar hook capping protein  85.22 
 
 		 230 aa  328  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1878  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  73.1 
 
 		 230 aa  257  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1494  flagellar hook capping protein  59.81 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0985  flagellar hook capping protein  58.86 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459314 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3964  flagellar hook capping protein  55.68 
 
 		 242 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4118  flagellar hook capping protein  56.25 
 
 		 233 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7244  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  47.91 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  47.24 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  46.91 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  46.88 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  46.88 
 
 		 226 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  43.59 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  44.78 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  39.51 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  36.99 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0689  flagellar hook capping protein  33.82 
 
 		 221 aa  108  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.603097  normal  0.525021 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2533  flagellar hook capping protein  35.52 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0113  flagellar hook capping protein  36.94 
 
 		 253 aa  99.8  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  34.72 
 
 		 245 aa  96.3  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  32.78 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  34.62 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  33.81 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0870  flagellar hook capping protein  36.93 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  31.18 
 
 		 222 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  30.57 
 
 		 230 aa  91.7  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  34.87 
 
 		 245 aa  90.9  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  29.74 
 
 		 263 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0764  flagellar hook capping protein  35.23 
 
 		 220 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  30.05 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  32.04 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  30.89 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  33.51 
 
 		 223 aa  85.9  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  28.23 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  28.95 
 
 		 220 aa  85.1  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  34.86 
 
 		 234 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4207  flagellar basal body rod modification protein  34.3 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  35 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  35 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  29.38 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  30.57 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  29.38 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  30.59 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  29.17 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  30 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  33.93 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  31.48 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  28.65 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3456  flagellar hook capping protein  33.11 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.290459  normal  0.317181 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  29.29 
 
 		 293 aa  82  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  34.2 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  27.62 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2595  flagellar basal body rod modification protein  30.51 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.613344  hitchhiker  0.000000237471 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  34.09 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  27.59 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  34.64 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  29.35 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  28.65 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  33.64 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  33.64 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  33.64 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  27.83 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  27.49 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  33.98 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  30.77 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  32.16 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  30.89 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1305  flagellar basal body rod modification protein  32.16 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2978  flagellar basal body rod modification protein  27.96 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150885  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  34.34 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  33.52 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  30.23 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  35.09 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  34.04 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  30.34 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  35.09 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  35.09 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  35.09 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  30.59 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  31.44 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  31.03 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  31.03 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  29.84 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  31.47 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  29.84 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  32.12 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  30.36 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  34.83 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1336  flagellar basal body rod modification protein  28.74 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  32.43 
 
 		 223 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  27.23 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  27.01 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0005  flagellar basal body rod modification protein  28.74 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3365  flagellar basal body rod modification protein  32.54 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1599  flagellar basal body rod modification protein  30 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3164  putative basal-body rod modification protein flgD  30.9 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562782  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  29.15 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  30.59 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1163  flagellar basal body rod modification protein  30.64 
 
 		 261 aa  72  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>