144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1639 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1639  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 218 aa  431  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.209665  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  30.77 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  30.3 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  30.51 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  29.85 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  29.85 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3571  flagellar hook capping protein  28.36 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  27.78 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  29.29 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  30.96 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3164  putative basal-body rod modification protein flgD  31.58 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562782  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  29.35 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  26.4 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  22.32 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  27.62 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0764  flagellar hook capping protein  29.15 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0870  flagellar hook capping protein  25.26 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  29.94 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  29.94 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  31.64 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  21.88 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  21.68 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  26.67 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  28.05 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  27.68 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  30.34 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  32.59 
 
 		 228 aa  62  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  28.35 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  29.38 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  27.11 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  25.13 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  30.51 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  27.47 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  26.44 
 
 		 265 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  27.13 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  25.86 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  26.77 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  28.18 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  26.23 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  26.97 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  27.51 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  27.14 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3829  flagellar hook capping protein  32.14 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  28.12 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3576  flagellar basal body rod modification protein  22.95 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3102  flagellar hook capping protein  31.25 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.576147  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0721  flagellar basal body rod modification protein  23.2 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  21.61 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  22.4 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3716  flagellar hook capping protein  30.97 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  26.56 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0225  flagellar basal body rod modification protein  23.2 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0009  flagellar basal body rod modification protein  24.88 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  25 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  24.7 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0641  flagellar basal body rod modification protein  23.2 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  25.21 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  28.09 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1472  flagellar hook capping protein  27.87 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  30 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1828  flagellar basal body rod modification protein  31.94 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.122643  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  30.17 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  27.56 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  30.7 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1772  flagellar basal body rod modification protein  31.94 
 
 		 192 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0208  flagellar basal body rod modification protein  23.89 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.577619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  23.27 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1569  flagellar basal body rod modification protein  31.94 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.554072  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  25.5 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  26.47 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  27.17 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  28.4 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  26.47 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0144  flagellar hook capping protein  29.73 
 
 		 159 aa  48.1  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  21.57 
 
 		 293 aa  48.1  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1479  basal-body rod modification protein FlgD  23.94 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1567  flagellar basal body rod modification protein  31.94 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1540  flagellar basal body rod modification protein  31.94 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1529  flagellar basal body rod modification protein  31.94 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1685  flagellar basal body rod modification protein  31.94 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  29.89 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1719  flagellar basal body rod modification protein  31.25 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1750  flagellar basal body rod modification protein  31.94 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  25.23 
 
 		 142 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0567  flagellar hook capping protein  25.66 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  30 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7244  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  22.34 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3627  flagellar basal body rod modification protein  30.56 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  30.95 
 
 		 142 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2289  flagellar hook capping protein  22.05 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  29.33 
 
 		 175 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  27.53 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  27.81 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3098  flagellar basal body rod modification protein  30.83 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085236  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  26.09 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  20.79 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  24.37 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  24.37 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  23.23 
 
 		 221 aa  45.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  23.23 
 
 		 221 aa  45.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>