232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3576 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3576  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 		 230 aa  456  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04911  flagellar basal body rod modification protein  52.38 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000738  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  50.43 
 
 		 227 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0208  flagellar basal body rod modification protein  42.27 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.577619 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0641  flagellar basal body rod modification protein  44.04 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0225  flagellar basal body rod modification protein  44.04 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0721  flagellar basal body rod modification protein  43.52 
 
 		 218 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0067  flagellar hook capping protein  40.7 
 
 		 221 aa  142  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0073  flagellar hook capping protein  41.4 
 
 		 219 aa  141  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0265  lateral flagellar rod protein LfgD  36.73 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3369  flagellar hook capping protein  36.73 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3969  flagellar hook capping protein  38.19 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3466  flagellar hook capping protein  37.19 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3649  flagellar hook capping protein  36.67 
 
 		 220 aa  122  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0186  flagellar basal body rod modification protein  30.65 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0239  flagellar basal body rod modification protein  31.16 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4673  flagellar basal body rod modification protein  31.58 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  32.66 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  32.66 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  32 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  33.91 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  31.98 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  31.98 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  32.99 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  31.08 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  32.32 
 
 		 221 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  29.44 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  27.83 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  34.66 
 
 		 221 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  33.62 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  33.16 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  30.21 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  30.21 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  29.35 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0567  flagellar hook capping protein  33.77 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  30.15 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  33.52 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  31.87 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  33.54 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  31.19 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  28.14 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  33.54 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  30.93 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  33.54 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  29.95 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  31.67 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  30.39 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  29.9 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  33.85 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  28.77 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  29.9 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  29.65 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  28.78 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  32.85 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  32.53 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  29.28 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  30.25 
 
 		 232 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  30.25 
 
 		 232 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  30.25 
 
 		 232 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  30.25 
 
 		 232 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  30.25 
 
 		 232 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  30.17 
 
 		 225 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  32.85 
 
 		 225 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  37.38 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  31.1 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  31.1 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  31.1 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  31.1 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  31.1 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  28.23 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  31.1 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  31.1 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  31.1 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1599  flagellar basal body rod modification protein  25.5 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  29.82 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  28.36 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  27.45 
 
 		 282 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02926  flagellar basal body rod modification protein  25.11 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  27.46 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  26.32 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  29.08 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  29.44 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  30.49 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2316  flagellar basal body rod modification protein  24.87 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.383064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  28.28 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  31.54 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  30.41 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  29.08 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  31.54 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  28.22 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  26.63 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  29.06 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3716  flagellar hook capping protein  27.69 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0870  flagellar hook capping protein  26.92 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  29.06 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  28.57 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1347  flagellar basal body rod modification protein  24.74 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.796846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  27.89 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3098  flagellar basal body rod modification protein  26.13 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>