234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000738 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000738  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  100 
 
 		 227 aa  457  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04911  flagellar basal body rod modification protein  85.96 
 
 		 228 aa  394  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3576  flagellar basal body rod modification protein  50.43 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0208  flagellar basal body rod modification protein  45.41 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.577619 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0641  flagellar basal body rod modification protein  43.16 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0721  flagellar basal body rod modification protein  43.16 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0225  flagellar basal body rod modification protein  42.63 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0073  flagellar hook capping protein  38.27 
 
 		 219 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3369  flagellar hook capping protein  36.77 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0265  lateral flagellar rod protein LfgD  36.77 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0067  flagellar hook capping protein  36.22 
 
 		 221 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3969  flagellar hook capping protein  40 
 
 		 220 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3466  flagellar hook capping protein  37.5 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0239  flagellar basal body rod modification protein  37.69 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3649  flagellar hook capping protein  35 
 
 		 220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0186  flagellar basal body rod modification protein  37.19 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4673  flagellar basal body rod modification protein  33.66 
 
 		 241 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795242 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  34.22 
 
 		 226 aa  91.7  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  32.38 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  32.38 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  33.15 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  33.15 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  30.1 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  28.83 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  28.72 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  28.35 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  29.95 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  30.05 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  29.9 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  30.65 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  29.14 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  26.11 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0567  flagellar hook capping protein  31.06 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  32 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  28.57 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  26.67 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  25.79 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  33.5 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  28.85 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  30.82 
 
 		 225 aa  72  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  28.91 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  35.51 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  30.17 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  29.75 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  27.04 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  37.3 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  35.54 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  29.79 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3716  flagellar hook capping protein  29.32 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  28.27 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  27.27 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  29.41 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  28.72 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  29.19 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  29.19 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  29.19 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  29.19 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  29.19 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  27.6 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  27.6 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  29.19 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  29.19 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  28.21 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  29.19 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  29.19 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  29.19 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  27.5 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  29.19 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  29.19 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  28.87 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  29.19 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  26.15 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  29.19 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  30.53 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  30.53 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  26.59 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  34.26 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  31.29 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  30.16 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3071  flagellar hook capping protein  31.97 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.113202 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  25 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  28.57 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3829  flagellar hook capping protein  29.46 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  30.63 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2732  flagellar hook capping protein  33.59 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000455072 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  32.65 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  29.58 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  26.67 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3102  flagellar hook capping protein  29.46 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.576147  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  26.57 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  30 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3571  flagellar hook capping protein  29.29 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  27.87 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  30 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0048  flagellar hook capping protein  33.07 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  30.07 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1472  flagellar hook capping protein  34.62 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  30 
 
 		 248 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  26.53 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  29.26 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>