238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3466 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3466  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 220 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3969  flagellar hook capping protein  88.18 
 
 		 220 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3649  flagellar hook capping protein  70 
 
 		 220 aa  317  7.999999999999999e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0067  flagellar hook capping protein  66.52 
 
 		 221 aa  296  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0073  flagellar hook capping protein  64.02 
 
 		 219 aa  279  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04911  flagellar basal body rod modification protein  38.89 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000738  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  37.5 
 
 		 227 aa  131  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3576  flagellar basal body rod modification protein  37.19 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0208  flagellar basal body rod modification protein  35.68 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.577619 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0721  flagellar basal body rod modification protein  32.37 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0225  flagellar basal body rod modification protein  32.37 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0641  flagellar basal body rod modification protein  32.68 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0239  flagellar basal body rod modification protein  30.91 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0186  flagellar basal body rod modification protein  30 
 
 		 231 aa  98.6  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  37.75 
 
 		 223 aa  95.1  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0265  lateral flagellar rod protein LfgD  27.18 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  37.4 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3369  flagellar hook capping protein  27.18 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  37.4 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  30.22 
 
 		 221 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  28.57 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  28.82 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  35.06 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  28.57 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4673  flagellar basal body rod modification protein  31.07 
 
 		 241 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795242 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  30.96 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  26.53 
 
 		 242 aa  89  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  29.53 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  29.53 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  35.54 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0567  flagellar hook capping protein  29.7 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  36.67 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  31.89 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  33.14 
 
 		 247 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  31.89 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  31.89 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  31.89 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  31.89 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  34.32 
 
 		 278 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  29.52 
 
 		 245 aa  86.3  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  27.89 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  30.85 
 
 		 248 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  36 
 
 		 240 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  30.85 
 
 		 248 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  31.68 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  29.23 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3716  flagellar hook capping protein  30.92 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  33.93 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  33.73 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  26.54 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  33.13 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  33.93 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  33.93 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  33.73 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  33.73 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  33.93 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  28.85 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  26.82 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  32.9 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  32.9 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  30.06 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  32.05 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  32.9 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  30.34 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  30.34 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  29.52 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  28.7 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  26.26 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  32.26 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  30 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  28.72 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  35.58 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  29.94 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  27.23 
 
 		 235 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  31.74 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251185 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  31.74 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  31.74 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  25.64 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  31.74 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  31.74 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  31.74 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  31.74 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3102  flagellar hook capping protein  27.85 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.576147  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1976  flagellar basal body rod modification protein  36.75 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  31.74 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3829  flagellar hook capping protein  27.85 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  29.29 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  29.31 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  30.41 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  30.3 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01288  flagellar basal body rod modification protein  27.46 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  30.3 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  25.14 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  32.43 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  26.94 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  24.19 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  32.82 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  30.15 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  28.21 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2732  flagellar hook capping protein  26.4 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000455072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>