244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3571 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3571  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 224 aa  449  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  35.96 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  33 
 
 		 226 aa  99  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  36 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  34.33 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  34.33 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  35.9 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  34.17 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  34.13 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  32.69 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  33.18 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  34.92 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7244  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  31.94 
 
 		 235 aa  85.5  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  31.79 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  33.79 
 
 		 220 aa  85.1  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  35.29 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  35.29 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  30.94 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  30.58 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1976  flagellar basal body rod modification protein  32 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0113  flagellar hook capping protein  32.98 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  31.3 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2732  flagellar hook capping protein  32.23 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000455072 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  30.99 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  30.87 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  26.57 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  32.14 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  32.37 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  32.37 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  33.5 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  27.49 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  30.96 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0567  flagellar hook capping protein  33.54 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  35.64 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  31.44 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  29.46 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  33.99 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  27.27 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  33.14 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  31.9 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  29.02 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  29.88 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  31.34 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3102  flagellar hook capping protein  31.32 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.576147  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  31.89 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  29.15 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  29.82 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  36.82 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3829  flagellar hook capping protein  31.87 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  30.8 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  30.8 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  30.41 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  33.01 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  29 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  30.93 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  33.01 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  33.01 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  33.01 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  30.48 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  33.01 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  32.11 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  29.19 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1639  flagellar hook capping protein  28.36 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.209665  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  28.95 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  32.06 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  35.32 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  31.44 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  30.19 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  30.19 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  30.19 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  30.19 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  30.19 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  32.69 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  32.54 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  31.84 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  28.37 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  27.69 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3365  flagellar basal body rod modification protein  36.64 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  28.37 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  28.37 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  36.72 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  39.13 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1623  flagellar basal body rod modification protein  32.88 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  32.84 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4207  flagellar basal body rod modification protein  32.91 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3716  flagellar hook capping protein  30.85 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  32.54 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  39.13 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  31.52 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  27.88 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  29.47 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1479  basal-body rod modification protein FlgD  32.21 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  28.64 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  30.26 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  30.36 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  28.64 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  28.64 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  28.64 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  28.99 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2595  flagellar basal body rod modification protein  49.32 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.613344  hitchhiker  0.000000237471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>