217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31150 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31150  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 186 aa  360  9e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0120404  normal  0.0821325 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2020  flagellar hook capping protein  49.65 
 
 		 161 aa  131  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.292444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2984  flagellar hook capping protein  51.22 
 
 		 138 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0752  flagellar hook capping protein  39.31 
 
 		 163 aa  99.4  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.966929  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  42.45 
 
 		 175 aa  97.4  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2340  flagellar hook capping protein  42.34 
 
 		 139 aa  87  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  29.01 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  38.46 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0856  flagellar hook capping protein-like protein  30.65 
 
 		 180 aa  72  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0971  flagellar hook capping protein  43.56 
 
 		 140 aa  70.5  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  39.78 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3102  flagellar hook capping protein  35.51 
 
 		 139 aa  67.4  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0961418  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0415  flagellar hook capping protein  30.15 
 
 		 155 aa  67.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0848  flagellar hook capping protein  34.86 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.538415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  32.39 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  31.73 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  35.51 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  42.5 
 
 		 263 aa  64.3  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  36.27 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  30 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  31.36 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  35.05 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2769  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.225291  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  33.91 
 
 		 129 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  36.19 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  27.66 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  45.1 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2166  flagellar hook capping protein  31.85 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2048  flagellar basal body rod modification protein  44.05 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.854141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  28.26 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1750  flagellar basal body rod modification protein  29.41 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1567  flagellar basal body rod modification protein  29.41 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1540  flagellar basal body rod modification protein  29.41 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1529  flagellar basal body rod modification protein  29.41 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1685  flagellar basal body rod modification protein  29.41 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0777  flagellar hook capping protein  32.14 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0403278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2038  flagellar hook capping protein  33.94 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  29.51 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0048  flagellar hook capping protein  33.83 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  37.5 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0059  flagellar hook capping protein  31.86 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  37.5 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  30.58 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0144  flagellar hook capping protein  36.36 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  40.74 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  34.02 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0472  flagellar hook capping protein  27.19 
 
 		 323 aa  58.2  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1828  flagellar basal body rod modification protein  29.71 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.122643  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  34.29 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  42.47 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  38.36 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  31.97 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1772  flagellar basal body rod modification protein  29.37 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  33.06 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  41.18 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  32.58 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1569  flagellar basal body rod modification protein  30.95 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.554072  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0009  flagellar basal body rod modification protein  36.08 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  39.44 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  31.3 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  40.74 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3627  flagellar basal body rod modification protein  32.11 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1398  flagellar hook capping protein  27.42 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.350528  normal  0.988245 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  38.46 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  35.29 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  32.23 
 
 		 225 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0041  flagellar basal body rod modification protein  30.77 
 
 		 294 aa  54.3  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  38.03 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2277  flagellar hook capping protein  32.41 
 
 		 133 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  33.96 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0080  flagellar basal body rod modification protein  30.77 
 
 		 294 aa  54.3  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1719  flagellar basal body rod modification protein  31.19 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2044  flagellar hook capping protein  37.68 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  33.93 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  34.29 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0057  flagellar basal body rod modification protein  30.77 
 
 		 287 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  36.47 
 
 		 238 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  28.46 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  33.93 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  40.58 
 
 		 240 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  35.29 
 
 		 242 aa  52  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0662  flagellar basal body rod modification protein  34.62 
 
 		 138 aa  52  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.25613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  36.59 
 
 		 229 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  31.1 
 
 		 237 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0641  flagellar basal body rod modification protein  36 
 
 		 218 aa  51.6  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  40.85 
 
 		 224 aa  51.6  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  40.85 
 
 		 225 aa  51.6  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0375  flagellar basal body rod modification protein  35.9 
 
 		 144 aa  51.2  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  35.48 
 
 		 215 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  35.48 
 
 		 215 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  38.81 
 
 		 231 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0699  flagellar basal body rod modification protein  33.65 
 
 		 138 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608637  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  32.35 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  38.81 
 
 		 231 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  32.35 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  38.81 
 
 		 231 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0688  flagellar basal body rod modification protein  33.65 
 
 		 138 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  32.35 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  38.53 
 
 		 138 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>