232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0848 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0848  flagellar hook capping protein  100 
 
 
144 aa  285  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.538415  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2340  flagellar hook capping protein  40.29 
 
 
139 aa  94.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  38.17 
 
 
175 aa  83.6  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0752  flagellar hook capping protein  36.67 
 
 
163 aa  82  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.966929  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  30.3 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0777  flagellar hook capping protein  41.44 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0403278  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0048  flagellar hook capping protein  36.64 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2984  flagellar hook capping protein  31.86 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  38.17 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2038  flagellar hook capping protein  35.38 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31150  flagellar hook capping protein  35.9 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0120404  normal  0.0821325 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  36.36 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0472  flagellar hook capping protein  29.46 
 
 
323 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04911  flagellar basal body rod modification protein  35.94 
 
 
228 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0415  flagellar hook capping protein  34.31 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  47.22 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  37.76 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  34.34 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3102  flagellar hook capping protein  30.91 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0961418  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  34.69 
 
 
227 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2769  flagellar basal body rod modification protein  36.54 
 
 
169 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.225291  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  36.07 
 
 
245 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2020  flagellar hook capping protein  31.58 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.292444  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  36 
 
 
237 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  37.35 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1759  flagellar hook capping protein  26.77 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  34.52 
 
 
147 aa  62  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6511  flagellar basal body rod modification protein  38.61 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  46.48 
 
 
218 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2277  flagellar hook capping protein  35.25 
 
 
133 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  31.86 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2595  flagellar basal body rod modification protein  36.94 
 
 
218 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.613344  hitchhiker  0.000000237471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  32.38 
 
 
230 aa  61.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  36.08 
 
 
129 aa  60.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2044  flagellar hook capping protein  40.48 
 
 
285 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  36.89 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0144  flagellar hook capping protein  32.69 
 
 
159 aa  60.5  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  40.43 
 
 
226 aa  60.5  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1398  flagellar hook capping protein  31.25 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.350528  normal  0.988245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1116  flagellar basal body rod modification protein  40.51 
 
 
135 aa  59.3  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  43.48 
 
 
263 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  33.09 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000738  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  38.89 
 
 
227 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  37.18 
 
 
225 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  31.46 
 
 
235 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0059  flagellar hook capping protein  33.08 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  37.18 
 
 
225 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  38.46 
 
 
226 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1502  flagellar hook capping protein  34.07 
 
 
263 aa  58.2  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  37.18 
 
 
225 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  50 
 
 
221 aa  57.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  40 
 
 
222 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  39.39 
 
 
242 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  36.46 
 
 
238 aa  57.4  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  36.67 
 
 
136 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0662  flagellar basal body rod modification protein  34.69 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.25613 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  36.47 
 
 
284 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2166  flagellar hook capping protein  28.36 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  32.93 
 
 
233 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  40 
 
 
215 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  40 
 
 
215 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  42.42 
 
 
265 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1750  flagellar basal body rod modification protein  26.92 
 
 
190 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1567  flagellar basal body rod modification protein  26.92 
 
 
190 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1540  flagellar basal body rod modification protein  26.92 
 
 
190 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1529  flagellar basal body rod modification protein  26.92 
 
 
190 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  42.86 
 
 
277 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  42.86 
 
 
280 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1685  flagellar basal body rod modification protein  26.92 
 
 
190 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  42.86 
 
 
277 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  42.86 
 
 
277 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  42.86 
 
 
280 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  42.86 
 
 
280 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  42.86 
 
 
277 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  42.22 
 
 
278 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  33.88 
 
 
221 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  33.88 
 
 
221 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7244  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  30 
 
 
235 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  47.76 
 
 
240 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  27.97 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3102  flagellar hook capping protein  43.94 
 
 
216 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.576147  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  36.36 
 
 
234 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3829  flagellar hook capping protein  43.94 
 
 
216 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  43.75 
 
 
221 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  32.1 
 
 
226 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  48.48 
 
 
221 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  30.59 
 
 
233 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  45.45 
 
 
222 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0856  flagellar hook capping protein-like protein  25.56 
 
 
180 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  38.64 
 
 
221 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  36.25 
 
 
223 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  37.93 
 
 
216 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3969  flagellar hook capping protein  31.53 
 
 
220 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3248  flagellar basal body rod modification protein  32.43 
 
 
253 aa  53.9  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  36.25 
 
 
223 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3576  flagellar basal body rod modification protein  34.88 
 
 
230 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0688  flagellar basal body rod modification protein  34.78 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136658  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  34.09 
 
 
227 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  48.48 
 
 
221 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>