232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0059 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0059  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 135 aa  266  7e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2277  flagellar hook capping protein  40.74 
 
 		 133 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0752  flagellar hook capping protein  43.64 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.966929  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  43.82 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1116  flagellar basal body rod modification protein  39.58 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  43.48 
 
 		 175 aa  72  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1502  flagellar hook capping protein  37.04 
 
 		 263 aa  71.2  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0777  flagellar hook capping protein  43.69 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0403278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  41.03 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  37.14 
 
 		 134 aa  67  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  44.44 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  53.42 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2340  flagellar hook capping protein  41.35 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2769  flagellar basal body rod modification protein  36.94 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.225291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  43.14 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  41.46 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  33.64 
 
 		 190 aa  63.9  0.0000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  48.05 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  48.05 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  39.32 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  52.05 
 
 		 233 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2044  flagellar hook capping protein  47.83 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  37.5 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0048  flagellar hook capping protein  39.05 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  51.32 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0472  flagellar hook capping protein  37.29 
 
 		 323 aa  60.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0662  flagellar basal body rod modification protein  36.79 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.25613 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  40.79 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  48.75 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3098  flagellar basal body rod modification protein  35.96 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6511  flagellar basal body rod modification protein  33.65 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2978  flagellar basal body rod modification protein  40.74 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150885  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1261  flagellar basal body rod modification protein  34.45 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31150  flagellar hook capping protein  32 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0120404  normal  0.0821325 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2960  flagellar basal body rod modification protein  35.96 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1418  flagellar basal body rod modification protein  35.96 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  42.17 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0375  flagellar basal body rod modification protein  41.67 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0415  flagellar hook capping protein  33.64 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2945  flagellar basal body rod modification protein  41.33 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  36 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  46.15 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  42.67 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  42.67 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1331  flagellar basal body rod modification protein  36.54 
 
 		 256 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1163  flagellar basal body rod modification protein  41.03 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3552  flagellar basal body rod modification protein  40.28 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  36.17 
 
 		 230 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  39.76 
 
 		 245 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0848  flagellar hook capping protein  32.5 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.538415  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  44.59 
 
 		 229 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  38.61 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3248  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  37.25 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  38.2 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1323  flagellar basal body rod modification protein  34.29 
 
 		 259 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  38.2 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0971  flagellar hook capping protein  33.93 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  38.03 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2166  flagellar hook capping protein  48.44 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0856  flagellar hook capping protein-like protein  33.9 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3571  flagellar hook capping protein  40.4 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  66.67 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  44.74 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  38.03 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  44.83 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  44.83 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  40.48 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  41.98 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  41.98 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  56.1 
 
 		 284 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  44.44 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1305  flagellar basal body rod modification protein  39.19 
 
 		 263 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  32.76 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1702  flagellar basal body rod modification protein  32.97 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  39 
 
 		 263 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0688  flagellar basal body rod modification protein  36.63 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0699  flagellar basal body rod modification protein  36.63 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608637  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2595  flagellar basal body rod modification protein  38.67 
 
 		 253 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2984  flagellar hook capping protein  28.57 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2316  flagellar basal body rod modification protein  38.16 
 
 		 242 aa  53.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.383064 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  41.77 
 
 		 223 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  36.62 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  41.77 
 
 		 223 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  36.96 
 
 		 226 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  41.86 
 
 		 218 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2909  flagellar hook capping protein  47.46 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1599  flagellar basal body rod modification protein  36.84 
 
 		 270 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  63.89 
 
 		 225 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3969  flagellar hook capping protein  31.34 
 
 		 220 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  36 
 
 		 282 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  66.67 
 
 		 226 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  30.97 
 
 		 222 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1347  flagellar basal body rod modification protein  35.53 
 
 		 260 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.796846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2710  flagellar hook capping protein  34.34 
 
 		 275 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  38.1 
 
 		 235 aa  51.2  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  46.94 
 
 		 221 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3466  flagellar hook capping protein  34.44 
 
 		 220 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  35.05 
 
 		 218 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>