241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0856 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0856  flagellar hook capping protein-like protein  100 
 
 		 180 aa  362  1e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  39.57 
 
 		 142 aa  99  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  34.88 
 
 		 134 aa  85.5  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2166  flagellar hook capping protein  34.62 
 
 		 164 aa  85.1  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0472  flagellar hook capping protein  45.95 
 
 		 323 aa  82  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  42.37 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  37.27 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  65.45 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  36.97 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2044  flagellar hook capping protein  36.97 
 
 		 285 aa  78.2  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  37.39 
 
 		 184 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  45.78 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  34.93 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  31.69 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2984  flagellar hook capping protein  33.08 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0752  flagellar hook capping protein  32.09 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.966929  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  44.71 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  37.29 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0415  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2020  flagellar hook capping protein  27.95 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.292444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31150  flagellar hook capping protein  30.65 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0120404  normal  0.0821325 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  37.74 
 
 		 263 aa  72  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  41.24 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  60 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0777  flagellar hook capping protein  35.77 
 
 		 140 aa  70.5  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0403278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  38.04 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  49.18 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  40.91 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  38.89 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  50 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  47.76 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  34.74 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  34.74 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  44.16 
 
 		 233 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  35.16 
 
 		 225 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  39.29 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  38.3 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2769  flagellar basal body rod modification protein  44.9 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.225291  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  49.25 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  49.25 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2340  flagellar hook capping protein  32.76 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  34.23 
 
 		 238 aa  64.3  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2277  flagellar hook capping protein  37.14 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1398  flagellar hook capping protein  28.69 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.350528  normal  0.988245 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  35.51 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  38.96 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  38.96 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  39.78 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3102  flagellar hook capping protein  32.23 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0961418  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2038  flagellar hook capping protein  32.74 
 
 		 136 aa  62  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2710  flagellar hook capping protein  35.42 
 
 		 275 aa  62  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6511  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2048  flagellar basal body rod modification protein  46.67 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.854141  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  35.42 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  32.33 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  34.09 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  27.27 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0047  flagellar basal body rod modification protein  34.34 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3552  flagellar basal body rod modification protein  31.78 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  42.53 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  40.26 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  40.26 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1502  flagellar hook capping protein  36.25 
 
 		 263 aa  58.2  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  44.23 
 
 		 218 aa  57.4  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  35.06 
 
 		 225 aa  57.8  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  29.41 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  29.41 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1702  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  38.46 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  38.46 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  29.63 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  32.63 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0662  flagellar basal body rod modification protein  27.27 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.25613 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0057  flagellar basal body rod modification protein  43.1 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1599  flagellar basal body rod modification protein  35.04 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0041  flagellar basal body rod modification protein  43.1 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01288  flagellar basal body rod modification protein  31.58 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  35.96 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  34.21 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0059  flagellar hook capping protein  33.9 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  44.44 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0080  flagellar basal body rod modification protein  43.1 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2978  flagellar basal body rod modification protein  38.67 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150885  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  30.93 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  32.26 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  33.98 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0048  flagellar hook capping protein  30 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0971  flagellar hook capping protein  34.94 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0009  flagellar basal body rod modification protein  42.37 
 
 		 263 aa  54.7  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  33.77 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1519  flagellar hook assembly protein FlgD  47.06 
 
 		 335 aa  54.7  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  33.77 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  35.06 
 
 		 236 aa  54.3  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1163  flagellar basal body rod modification protein  31.75 
 
 		 261 aa  54.3  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0699  flagellar basal body rod modification protein  30.91 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608637  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0764  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0870  flagellar hook capping protein  35.21 
 
 		 218 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  43.08 
 
 		 227 aa  53.9  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0688  flagellar basal body rod modification protein  30.91 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  32.63 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>