253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3552 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3552  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 		 141 aa  265  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0047  flagellar basal body rod modification protein  67.59 
 
 		 135 aa  138  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  57.8 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  57.8 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  56.88 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  56.64 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1116  flagellar basal body rod modification protein  58.18 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0375  flagellar basal body rod modification protein  53.21 
 
 		 144 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0699  flagellar basal body rod modification protein  58.25 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608637  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0688  flagellar basal body rod modification protein  58.25 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  45.86 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0662  flagellar basal body rod modification protein  58.25 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.25613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1702  flagellar basal body rod modification protein  51.4 
 
 		 139 aa  114  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6511  flagellar basal body rod modification protein  52.43 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0343  flagellar basal body rod modification protein  51.16 
 
 		 147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.644683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0769  flagellar basal body rod modification protein  47.71 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  44.95 
 
 		 190 aa  97.4  5e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  35.59 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  36.89 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  37.59 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  43.96 
 
 		 245 aa  70.9  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  43.16 
 
 		 226 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  45.63 
 
 		 228 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  43.16 
 
 		 226 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  39.58 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  46.67 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  40.37 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  43.16 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  43.75 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  46.97 
 
 		 245 aa  67.4  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4207  flagellar basal body rod modification protein  46.38 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2038  flagellar hook capping protein  34.43 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  38.78 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2978  flagellar basal body rod modification protein  55.17 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150885  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0144  flagellar hook capping protein  38.94 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1759  flagellar hook capping protein  36.17 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0113  flagellar hook capping protein  44.44 
 
 		 253 aa  63.9  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  46.15 
 
 		 221 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2277  flagellar hook capping protein  33.03 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  36.21 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  49.45 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  49.45 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  38.82 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  38.38 
 
 		 184 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2595  flagellar basal body rod modification protein  45.71 
 
 		 218 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.613344  hitchhiker  0.000000237471 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2769  flagellar basal body rod modification protein  40.22 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.225291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  30.51 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0856  flagellar hook capping protein-like protein  30.77 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  40.58 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2533  flagellar hook capping protein  40.24 
 
 		 229 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0005  flagellar basal body rod modification protein  42.03 
 
 		 222 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  37.89 
 
 		 215 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1336  flagellar basal body rod modification protein  45.59 
 
 		 222 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  37 
 
 		 237 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  37.89 
 
 		 215 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  46.97 
 
 		 221 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  46.97 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  40.91 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0073  flagellar hook capping protein  36.78 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  45.05 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0415  flagellar hook capping protein  28.33 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0048  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0059  flagellar hook capping protein  39.73 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  35.71 
 
 		 284 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  36.56 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  46.58 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  37.23 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  42.03 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1502  flagellar hook capping protein  41.18 
 
 		 263 aa  57.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0870  flagellar hook capping protein  41.98 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  37.38 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3576  flagellar basal body rod modification protein  39.64 
 
 		 230 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 235 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  35.83 
 
 		 229 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  47.06 
 
 		 277 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  47.06 
 
 		 280 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2166  flagellar hook capping protein  31.16 
 
 		 164 aa  57  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  46.15 
 
 		 221 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  47.06 
 
 		 277 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  47.06 
 
 		 277 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  47.06 
 
 		 280 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  47.06 
 
 		 277 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  47.06 
 
 		 278 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  47.06 
 
 		 280 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  33.62 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  42.31 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1519  flagellar hook assembly protein FlgD  36.36 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  37.82 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0689  flagellar hook capping protein  53.66 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.603097  normal  0.525021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3969  flagellar hook capping protein  33.64 
 
 		 220 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3365  flagellar basal body rod modification protein  50 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  38.83 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  42.31 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  38.83 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  42.31 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  42.31 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  27.12 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  43.06 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  30.17 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>