244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1116 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1116  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 		 135 aa  265  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3552  flagellar basal body rod modification protein  58.04 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  45.04 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  42.4 
 
 		 190 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6511  flagellar basal body rod modification protein  49.58 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0047  flagellar basal body rod modification protein  57.14 
 
 		 135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  49.12 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  42.86 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1702  flagellar basal body rod modification protein  47.27 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  47.79 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  47.79 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0375  flagellar basal body rod modification protein  46.9 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0662  flagellar basal body rod modification protein  49.06 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.25613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0688  flagellar basal body rod modification protein  48.11 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0699  flagellar basal body rod modification protein  48.11 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608637  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0343  flagellar basal body rod modification protein  45.26 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.644683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0769  flagellar basal body rod modification protein  40.54 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0059  flagellar hook capping protein  37.96 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  36.21 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0048  flagellar hook capping protein  37.98 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  35.51 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2277  flagellar hook capping protein  34.23 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  34.88 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2340  flagellar hook capping protein  35.4 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  29.63 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  45.83 
 
 		 228 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  33.67 
 
 		 147 aa  67  0.00000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  50 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  42.86 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  42.86 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  29.2 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  33.05 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  45.98 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  35.71 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1529  flagellar basal body rod modification protein  34.88 
 
 		 190 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  37.63 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  41.03 
 
 		 226 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1750  flagellar basal body rod modification protein  34.88 
 
 		 190 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0113  flagellar hook capping protein  45.21 
 
 		 253 aa  61.6  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1567  flagellar basal body rod modification protein  34.88 
 
 		 190 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1540  flagellar basal body rod modification protein  34.88 
 
 		 190 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  45.83 
 
 		 221 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  45.83 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  45.68 
 
 		 221 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2044  flagellar hook capping protein  31.09 
 
 		 285 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1685  flagellar basal body rod modification protein  34.88 
 
 		 190 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0752  flagellar hook capping protein  32.77 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.966929  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  38.64 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  42.17 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  38.21 
 
 		 245 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  36.17 
 
 		 237 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1828  flagellar basal body rod modification protein  31.78 
 
 		 192 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.122643  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  41.25 
 
 		 226 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0848  flagellar hook capping protein  40.51 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.538415  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2769  flagellar basal body rod modification protein  39.77 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.225291  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0073  flagellar hook capping protein  35 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0415  flagellar hook capping protein  30 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  45.33 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0971  flagellar hook capping protein  39.32 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  50.75 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  41.79 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  39.78 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4207  flagellar basal body rod modification protein  38.1 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  50.75 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1569  flagellar basal body rod modification protein  31.09 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.554072  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0067  flagellar hook capping protein  32.62 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  33.62 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3969  flagellar hook capping protein  31.62 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  44.12 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  48.15 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  32.38 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  48.15 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  48.15 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3627  flagellar basal body rod modification protein  31.97 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  42.31 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  39 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1772  flagellar basal body rod modification protein  30.47 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1502  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 263 aa  57.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3466  flagellar hook capping protein  32.11 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2978  flagellar basal body rod modification protein  44.78 
 
 		 231 aa  57.4  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150885  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  46.84 
 
 		 247 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  38.82 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  46.84 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  34.69 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  29.25 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3649  flagellar hook capping protein  34.19 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1719  flagellar basal body rod modification protein  31.15 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2166  flagellar hook capping protein  31.09 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  28.33 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  46.75 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  47.37 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  46.15 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  46.75 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2710  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  37.5 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  46.75 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0472  flagellar hook capping protein  33.94 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  46.75 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  46.15 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  46.75 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>