238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2402 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  40.52 
 
 		 134 aa  92  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2769  flagellar basal body rod modification protein  44.44 
 
 		 169 aa  87.8  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.225291  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  38.79 
 
 		 284 aa  82  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  38.61 
 
 		 142 aa  80.5  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1759  flagellar hook capping protein  30.43 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2038  flagellar hook capping protein  35.78 
 
 		 136 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  36.7 
 
 		 147 aa  73.9  0.000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0752  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.966929  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  39.13 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  31.37 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  37.5 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  37.5 
 
 		 227 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  44.58 
 
 		 263 aa  70.9  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0415  flagellar hook capping protein  36.04 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  35.92 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31150  flagellar hook capping protein  29.23 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0120404  normal  0.0821325 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0856  flagellar hook capping protein-like protein  49.18 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2710  flagellar hook capping protein  31.16 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2340  flagellar hook capping protein  33.68 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  42.47 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  34.31 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1502  flagellar hook capping protein  33.08 
 
 		 263 aa  68.2  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0472  flagellar hook capping protein  42.31 
 
 		 323 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  28.97 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3552  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  36.9 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2044  flagellar hook capping protein  45.59 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6511  flagellar basal body rod modification protein  34.07 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  39.13 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2277  flagellar hook capping protein  37.62 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  35.56 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  37.5 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  44.29 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1116  flagellar basal body rod modification protein  33.96 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2984  flagellar hook capping protein  31.52 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0048  flagellar hook capping protein  31.88 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0777  flagellar hook capping protein  37.38 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0403278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0662  flagellar basal body rod modification protein  39.71 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.25613 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2166  flagellar hook capping protein  33.08 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  35.04 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  40 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  40.82 
 
 		 140 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0848  flagellar hook capping protein  37.78 
 
 		 144 aa  64.3  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.538415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  31.36 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0375  flagellar basal body rod modification protein  38.82 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  37.04 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  39.44 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  38.46 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0971  flagellar hook capping protein  39.13 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  38.46 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  43.66 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  41.1 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0699  flagellar basal body rod modification protein  35.71 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608637  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0688  flagellar basal body rod modification protein  35.71 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  38.46 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0009  flagellar basal body rod modification protein  43.84 
 
 		 263 aa  62  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  30.43 
 
 		 136 aa  62  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  37.35 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  35.66 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  35.48 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  32.18 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  32.18 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  28.57 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2048  flagellar basal body rod modification protein  35.42 
 
 		 235 aa  60.8  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.854141  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  39.39 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  36.71 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0769  flagellar basal body rod modification protein  30.11 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  36.14 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0057  flagellar basal body rod modification protein  32.2 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1702  flagellar basal body rod modification protein  30.77 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2020  flagellar hook capping protein  28.35 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.292444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  37.5 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  36.25 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  39.77 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0041  flagellar basal body rod modification protein  34.02 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1567  flagellar basal body rod modification protein  31.25 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1540  flagellar basal body rod modification protein  31.25 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1529  flagellar basal body rod modification protein  31.25 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1685  flagellar basal body rod modification protein  31.25 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  39.44 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  40.28 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1750  flagellar basal body rod modification protein  31.25 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0080  flagellar basal body rod modification protein  34.02 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  39.39 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  39.39 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0059  flagellar hook capping protein  36 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  40 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3102  flagellar hook capping protein  29.91 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0961418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  40.28 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  34.15 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  31.58 
 
 		 234 aa  57  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  32.63 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  26.32 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0047  flagellar basal body rod modification protein  32.94 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  39.19 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  31.87 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0144  flagellar hook capping protein  28.83 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  38.03 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0208  flagellar basal body rod modification protein  33.04 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.577619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>