202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3102 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3102  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 139 aa  277  3e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0961418  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2020  flagellar hook capping protein  28.68 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.292444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31150  flagellar hook capping protein  35.45 
 
 		 186 aa  67  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0120404  normal  0.0821325 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2984  flagellar hook capping protein  32.48 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0415  flagellar hook capping protein  33.02 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0472  flagellar hook capping protein  37.19 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  30.28 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2340  flagellar hook capping protein  29.71 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0848  flagellar hook capping protein  30.91 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.538415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  36.96 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  32.76 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  31.58 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  33.65 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0856  flagellar hook capping protein-like protein  32.23 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  35.96 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  36.13 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  33.71 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  33.71 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2038  flagellar hook capping protein  30.77 
 
 		 136 aa  60.1  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  33.71 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  31.53 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  33.02 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  30.95 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  36.47 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  29.91 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  34.91 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  28.87 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  26.47 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1567  flagellar basal body rod modification protein  28.85 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1540  flagellar basal body rod modification protein  28.85 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1529  flagellar basal body rod modification protein  28.85 
 
 		 190 aa  57  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1685  flagellar basal body rod modification protein  28.85 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  40.85 
 
 		 226 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1750  flagellar basal body rod modification protein  28.85 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1759  flagellar hook capping protein  25.42 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  37.97 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0769  flagellar basal body rod modification protein  36.26 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0777  flagellar hook capping protein  33.04 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0403278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  45.45 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  56.52 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1365  flagellar basal body rod modification protein  35.14 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.49616  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2277  flagellar hook capping protein  33.67 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2710  flagellar hook capping protein  34.23 
 
 		 275 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  27.43 
 
 		 265 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3627  flagellar basal body rod modification protein  29.73 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  39.19 
 
 		 225 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0144  flagellar hook capping protein  31.25 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  39.19 
 
 		 225 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1719  flagellar basal body rod modification protein  29.73 
 
 		 192 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  33.33 
 
 		 263 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  39.19 
 
 		 225 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  38.03 
 
 		 222 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1828  flagellar basal body rod modification protein  29.73 
 
 		 192 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.122643  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  39.19 
 
 		 233 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1772  flagellar basal body rod modification protein  29.73 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  41.18 
 
 		 224 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2166  flagellar hook capping protein  29.06 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1569  flagellar basal body rod modification protein  29.73 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.554072  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  42.31 
 
 		 223 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  60 
 
 		 235 aa  52  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3071  flagellar hook capping protein  34.31 
 
 		 217 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.113202 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  30.21 
 
 		 232 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  41.18 
 
 		 224 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2048  flagellar basal body rod modification protein  57.89 
 
 		 235 aa  51.6  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.854141  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  35.05 
 
 		 251 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1976  flagellar basal body rod modification protein  51.16 
 
 		 235 aa  50.8  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0030  flagellar hook capping protein  39.74 
 
 		 221 aa  50.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0375  flagellar basal body rod modification protein  32.18 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  32.94 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  41.18 
 
 		 218 aa  50.4  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  35.05 
 
 		 248 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  35.05 
 
 		 248 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  35.05 
 
 		 248 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  40.91 
 
 		 223 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  35.05 
 
 		 248 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  35.05 
 
 		 248 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  31.17 
 
 		 234 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  31.25 
 
 		 221 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  44.23 
 
 		 277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6511  flagellar basal body rod modification protein  27.08 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  44.23 
 
 		 280 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2289  flagellar hook capping protein  41.38 
 
 		 229 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  31.25 
 
 		 215 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  44.23 
 
 		 278 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0752  flagellar hook capping protein  29.63 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.966929  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  31.17 
 
 		 235 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  44.23 
 
 		 277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  44.23 
 
 		 277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  31.25 
 
 		 215 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  44.23 
 
 		 280 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  44.23 
 
 		 280 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  44.23 
 
 		 277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  34.52 
 
 		 221 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  36.71 
 
 		 223 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  32.22 
 
 		 218 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  34.02 
 
 		 247 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  36.49 
 
 		 233 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  32.88 
 
 		 227 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0699  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608637  normal  0.189047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>