255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0281 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 		 138 aa  276  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  63.89 
 
 		 129 aa  153  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  59.63 
 
 		 136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  57.8 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  57.8 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0662  flagellar basal body rod modification protein  52.34 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.25613 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0375  flagellar basal body rod modification protein  54.13 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0688  flagellar basal body rod modification protein  51.4 
 
 		 138 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0699  flagellar basal body rod modification protein  51.4 
 
 		 138 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608637  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6511  flagellar basal body rod modification protein  52.25 
 
 		 142 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1702  flagellar basal body rod modification protein  54.21 
 
 		 139 aa  120  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0769  flagellar basal body rod modification protein  51.89 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  51.38 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0343  flagellar basal body rod modification protein  54.13 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.644683 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3552  flagellar basal body rod modification protein  50.46 
 
 		 141 aa  114  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1116  flagellar basal body rod modification protein  44.55 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0047  flagellar basal body rod modification protein  46.3 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  41.57 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  36.29 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0005  flagellar basal body rod modification protein  43.14 
 
 		 222 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1336  flagellar basal body rod modification protein  42.16 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0113  flagellar hook capping protein  47.22 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  36.52 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2978  flagellar basal body rod modification protein  46.67 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150885  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  47.89 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  35.56 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  47.89 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  48.48 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  37.5 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2277  flagellar hook capping protein  35.58 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  47.22 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1502  flagellar hook capping protein  43.59 
 
 		 263 aa  64.7  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  37.38 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  39.09 
 
 		 227 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  38.98 
 
 		 237 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  36.84 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  38.14 
 
 		 228 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  47.44 
 
 		 226 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  47.44 
 
 		 226 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  38.3 
 
 		 226 aa  63.5  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  50.63 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2595  flagellar basal body rod modification protein  42.68 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.613344  hitchhiker  0.000000237471 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  35.16 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  36.63 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  40.45 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4207  flagellar basal body rod modification protein  51.79 
 
 		 221 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  43.08 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  43.24 
 
 		 218 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3466  flagellar hook capping protein  33.93 
 
 		 220 aa  60.8  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0073  flagellar hook capping protein  38.37 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2769  flagellar basal body rod modification protein  44.12 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.225291  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1759  flagellar hook capping protein  31.2 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  32.74 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  40.74 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3365  flagellar basal body rod modification protein  43.96 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  38.04 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  44.12 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2710  flagellar hook capping protein  38.82 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3969  flagellar hook capping protein  32.56 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  37.36 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  38.78 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0777  flagellar hook capping protein  40.22 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0403278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  37.36 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0848  flagellar hook capping protein  39.56 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.538415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  41.43 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  47.06 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3649  flagellar hook capping protein  35.29 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  33.66 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  39.76 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  32.2 
 
 		 222 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  43.04 
 
 		 226 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  44.12 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  35.51 
 
 		 284 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0144  flagellar hook capping protein  33.65 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  43.66 
 
 		 229 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2038  flagellar hook capping protein  31.62 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  42.35 
 
 		 229 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  47.06 
 
 		 240 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0689  flagellar hook capping protein  60.98 
 
 		 221 aa  57  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.603097  normal  0.525021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0415  flagellar hook capping protein  32.12 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  47.46 
 
 		 230 aa  57  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  45.45 
 
 		 221 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  42.55 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7244  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  33.05 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  41.67 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0059  flagellar hook capping protein  40.48 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  37.18 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  33.63 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0067  flagellar hook capping protein  34 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2533  flagellar hook capping protein  41.43 
 
 		 229 aa  54.3  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04911  flagellar basal body rod modification protein  42.62 
 
 		 228 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2595  flagellar basal body rod modification protein  38.96 
 
 		 253 aa  54.7  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3576  flagellar basal body rod modification protein  50 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000738  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  38.67 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  40.43 
 
 		 237 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2732  flagellar hook capping protein  42.68 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000455072 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1623  flagellar basal body rod modification protein  50.98 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  39.53 
 
 		 242 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  32.05 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  38.67 
 
 		 220 aa  53.9  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>