227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0769 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0769  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 		 151 aa  293  7e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  46.62 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0375  flagellar basal body rod modification protein  51.4 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  49.11 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0343  flagellar basal body rod modification protein  46.21 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.644683 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0662  flagellar basal body rod modification protein  50 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.25613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3552  flagellar basal body rod modification protein  47.75 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  45.45 
 
 		 136 aa  103  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0699  flagellar basal body rod modification protein  47.71 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608637  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0688  flagellar basal body rod modification protein  47.71 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136658  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  44.55 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1702  flagellar basal body rod modification protein  44.76 
 
 		 139 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  44.55 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0047  flagellar basal body rod modification protein  47.27 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6511  flagellar basal body rod modification protein  44.95 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  39.82 
 
 		 190 aa  84.3  5e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1116  flagellar basal body rod modification protein  40.54 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  39.6 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0113  flagellar hook capping protein  54.69 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0073  flagellar hook capping protein  44.16 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4207  flagellar basal body rod modification protein  50.85 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  43.4 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  43.53 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1336  flagellar basal body rod modification protein  54 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0005  flagellar basal body rod modification protein  54 
 
 		 222 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  34.62 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  38.46 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  38.46 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2595  flagellar basal body rod modification protein  52 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.613344  hitchhiker  0.000000237471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  40 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0415  flagellar hook capping protein  34.88 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  31.48 
 
 		 245 aa  62  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0067  flagellar hook capping protein  42.31 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  32.1 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0777  flagellar hook capping protein  42.22 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0403278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 223 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  29.47 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  50 
 
 		 221 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  31.82 
 
 		 134 aa  60.1  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  45.71 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7244  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  34.23 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0144  flagellar hook capping protein  36.84 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  50 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  38.89 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2710  flagellar hook capping protein  43.04 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  43.08 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  41.56 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04911  flagellar basal body rod modification protein  43.82 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  48.08 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  42.59 
 
 		 223 aa  57  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  35.87 
 
 		 226 aa  57  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  39.09 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  43.69 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3466  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  44.44 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1759  flagellar hook capping protein  34.52 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  35.71 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  33.93 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3365  flagellar basal body rod modification protein  43.94 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0265  lateral flagellar rod protein LfgD  43.66 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3369  flagellar hook capping protein  43.66 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3102  flagellar hook capping protein  35.87 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0961418  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  43.52 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  43.52 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  43.52 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  43.52 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  40.54 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3649  flagellar hook capping protein  38.67 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2978  flagellar basal body rod modification protein  40.62 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150885  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  35.56 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  43.52 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  43.52 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  35.8 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000738  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  41.46 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  37.14 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  42.59 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  42.59 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2277  flagellar hook capping protein  32.63 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3969  flagellar hook capping protein  36.49 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  34.88 
 
 		 284 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  38.24 
 
 		 222 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  44.12 
 
 		 240 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  44.12 
 
 		 240 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  35.63 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  45.07 
 
 		 220 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  40.24 
 
 		 228 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  32.65 
 
 		 220 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  30.69 
 
 		 184 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0971  flagellar hook capping protein  41.67 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0057  flagellar basal body rod modification protein  39.29 
 
 		 287 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  48.89 
 
 		 218 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  38.16 
 
 		 233 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0041  flagellar basal body rod modification protein  39.29 
 
 		 294 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  41.51 
 
 		 218 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3576  flagellar basal body rod modification protein  39.33 
 
 		 230 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0080  flagellar basal body rod modification protein  39.29 
 
 		 294 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0472  flagellar hook capping protein  32.29 
 
 		 323 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  38.57 
 
 		 226 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  39.25 
 
 		 237 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>