206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2909 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2909  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 100 aa  200  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  48 
 
 		 226 aa  72  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  46.05 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  51.67 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  46.27 
 
 		 223 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  52.63 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  52.63 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3248  flagellar basal body rod modification protein  60.42 
 
 		 253 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1261  flagellar basal body rod modification protein  60.42 
 
 		 256 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1331  flagellar basal body rod modification protein  60.42 
 
 		 256 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1323  flagellar basal body rod modification protein  60.42 
 
 		 259 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2595  flagellar basal body rod modification protein  60.42 
 
 		 253 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  46.05 
 
 		 248 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  39.44 
 
 		 221 aa  63.5  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  46.05 
 
 		 248 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  46.05 
 
 		 248 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  39.44 
 
 		 221 aa  63.5  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  58.33 
 
 		 236 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2960  flagellar basal body rod modification protein  58.33 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1418  flagellar basal body rod modification protein  58.33 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2945  flagellar basal body rod modification protein  58.33 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3098  flagellar basal body rod modification protein  58.33 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1347  flagellar basal body rod modification protein  56.25 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.796846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01288  flagellar basal body rod modification protein  56.25 
 
 		 235 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3571  flagellar hook capping protein  40.23 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  43.9 
 
 		 247 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  60.47 
 
 		 245 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1502  flagellar hook capping protein  41.18 
 
 		 263 aa  60.8  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1163  flagellar basal body rod modification protein  57.45 
 
 		 261 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  54.17 
 
 		 235 aa  60.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  47.76 
 
 		 248 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  47.76 
 
 		 248 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1599  flagellar basal body rod modification protein  55.32 
 
 		 270 aa  60.1  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  43.1 
 
 		 226 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  50.94 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  50.94 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  42.67 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  50.94 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  42.67 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  38.46 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  49.06 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  49.06 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  50.94 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  54.17 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  50.94 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  42.67 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  50.94 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  53.33 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  50.94 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  42.67 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  50.94 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  42.67 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  42.67 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  42.67 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  50.94 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  42.67 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  41.1 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1342  flagellar basal body rod modification protein  54.17 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  41.1 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2769  flagellar basal body rod modification protein  47.27 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.225291  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  50.94 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  50.94 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  52.94 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  50.94 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  50.94 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2316  flagellar basal body rod modification protein  53.19 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.383064 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  49.06 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  50.94 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1305  flagellar basal body rod modification protein  53.19 
 
 		 263 aa  57.8  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  42.62 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2166  flagellar hook capping protein  39.24 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2044  flagellar hook capping protein  57.14 
 
 		 285 aa  57.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1589  flagellar basal body rod modification protein  49.06 
 
 		 236 aa  57.4  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  31.86 
 
 		 227 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  44.64 
 
 		 226 aa  57  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02926  flagellar basal body rod modification protein  51.92 
 
 		 228 aa  57  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0777  flagellar hook capping protein  63.16 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0403278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  34.48 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  42.62 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  41.82 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  47.17 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3716  flagellar hook capping protein  45.28 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  43.64 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  42.25 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  44.44 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  45.28 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  47.17 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  43.64 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  38.03 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  47.37 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  47.37 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  47.06 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  44.44 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  40.98 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  45.28 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  47.46 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3102  flagellar hook capping protein  40.68 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.576147  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1976  flagellar basal body rod modification protein  44.64 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  45.28 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3829  flagellar hook capping protein  40.68 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>