More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0145 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0145  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 210 aa  424  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.248769  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0375  ABC transporter, ATP-binding protein  50.97 
 
 		 316 aa  215  4e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.09 
 
 		 353 aa  208  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.06 
 
 		 353 aa  206  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.06 
 
 		 353 aa  206  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  49.51 
 
 		 353 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.61 
 
 		 362 aa  204  8e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0655  ABC transporter related  47.55 
 
 		 350 aa  203  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.22105 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.54 
 
 		 353 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  47.09 
 
 		 328 aa  202  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  47.62 
 
 		 366 aa  201  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  44.02 
 
 		 348 aa  201  7e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.63 
 
 		 352 aa  201  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  45.5 
 
 		 349 aa  201  9e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 		 330 aa  200  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  44.66 
 
 		 339 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1101  ABC transport system ATP-binding protein  49.51 
 
 		 333 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.63 
 
 		 354 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  44.23 
 
 		 348 aa  199  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  46.63 
 
 		 352 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  46.6 
 
 		 329 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  45.15 
 
 		 349 aa  198  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1829  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.81 
 
 		 354 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  46.63 
 
 		 352 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  45.15 
 
 		 329 aa  198  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5851  ABC transporter ATP-binding protein  46.01 
 
 		 351 aa  198  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228594  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0889  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.81 
 
 		 348 aa  198  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000209161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  45.97 
 
 		 349 aa  197  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  44.44 
 
 		 329 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.53 
 
 		 352 aa  197  7.999999999999999e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  51.61 
 
 		 353 aa  197  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  45.19 
 
 		 351 aa  197  9e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.44 
 
 		 329 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.76 
 
 		 377 aa  196  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  45.15 
 
 		 329 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.63 
 
 		 370 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1568  ABC transporter related  46.83 
 
 		 323 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  45.5 
 
 		 349 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  49.2 
 
 		 356 aa  196  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  48.78 
 
 		 344 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  43.54 
 
 		 348 aa  195  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0489  ABC transporter, ATP-binding protein  46.83 
 
 		 347 aa  195  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  46.12 
 
 		 330 aa  196  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  45.67 
 
 		 353 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  44.66 
 
 		 357 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  46.53 
 
 		 349 aa  195  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  47.6 
 
 		 333 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4379  ABC transporter related  46.6 
 
 		 355 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  45.63 
 
 		 331 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  45.63 
 
 		 329 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 383 aa  195  5.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  45.63 
 
 		 329 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.55 
 
 		 353 aa  194  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  46.12 
 
 		 331 aa  194  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  43.78 
 
 		 359 aa  194  6e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  46.12 
 
 		 353 aa  194  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  44.93 
 
 		 329 aa  194  7e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  45.63 
 
 		 330 aa  194  8.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  46.12 
 
 		 352 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  45.63 
 
 		 348 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  46.83 
 
 		 343 aa  194  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  46.12 
 
 		 366 aa  194  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  46.12 
 
 		 353 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.23 
 
 		 359 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  45.85 
 
 		 323 aa  193  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  46.38 
 
 		 362 aa  193  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  46.86 
 
 		 352 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  46.31 
 
 		 347 aa  192  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  44.39 
 
 		 364 aa  192  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.71 
 
 		 372 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  46.08 
 
 		 353 aa  192  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  44.6 
 
 		 361 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  43 
 
 		 339 aa  192  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 		 366 aa  192  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 343 aa  192  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  44.06 
 
 		 353 aa  192  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  47.12 
 
 		 333 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  45.63 
 
 		 346 aa  192  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 		 333 aa  191  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1474  ABC transporter related protein  42.65 
 
 		 337 aa  191  5e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00799241  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  44.86 
 
 		 353 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  45.15 
 
 		 353 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  46.12 
 
 		 368 aa  191  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2023  ABC transporter related  45.59 
 
 		 366 aa  191  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 		 333 aa  191  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.41 
 
 		 363 aa  191  5e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  45.63 
 
 		 346 aa  191  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  44.39 
 
 		 363 aa  191  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1284  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  44.76 
 
 		 426 aa  191  6e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.6 
 
 		 380 aa  191  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000938132  hitchhiker  0.00113993 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  46.63 
 
 		 333 aa  191  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.74 
 
 		 357 aa  191  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0496  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  44.08 
 
 		 359 aa  191  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 		 333 aa  191  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  45.67 
 
 		 360 aa  191  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.63 
 
 		 380 aa  191  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0661243  hitchhiker  0.000000930284 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2149  ABC transporter related  46.92 
 
 		 353 aa  191  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  46.38 
 
 		 350 aa  191  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  45.67 
 
 		 360 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  45.67 
 
 		 360 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>