More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0397 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0397  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 228 aa  461  1e-129  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.01 
 
 		 217 aa  198  6e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.75 
 
 		 221 aa  197  9e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.01 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.83 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.26 
 
 		 218 aa  195  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.74 
 
 		 219 aa  191  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.73 
 
 		 218 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.2 
 
 		 222 aa  187  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.67 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.27 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2195  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.5 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.27 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.27 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.27 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.27 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.27 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.27 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.27 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.77 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.77 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1649  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.33 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.77 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  45.59 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.73 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0833  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.63 
 
 		 216 aa  181  7e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4448  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.93 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.79 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.38 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.89 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.19 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.89 
 
 		 235 aa  179  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  41.43 
 
 		 221 aa  179  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0481  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.77 
 
 		 215 aa  178  5.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.27 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.57 
 
 		 217 aa  178  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.86 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.28 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0469  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.51 
 
 		 221 aa  177  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0827  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.53 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.08 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.53 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.08 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.78 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 		 227 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0536  Ribulose-phosphate 3-epimerase  40.95 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1024  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.54 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0651  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0532  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.03 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.266071  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1858  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.89 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.81 
 
 		 220 aa  175  6e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.59 
 
 		 220 aa  175  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1507  Ribulose-phosphate 3-epimerase  39.07 
 
 		 220 aa  174  7e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1430  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.75 
 
 		 236 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0377706 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.86 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.63 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0481  Ribulose-phosphate 3-epimerase  39.19 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0743  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.29 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000598804 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2864  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.27 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.63 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1319  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.29 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.08 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.3 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1605  ribulose-phosphate 3-epimerase (D-ribulose-5-phosphate 3-epimerase)  42.52 
 
 		 217 aa  172  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00660357  normal  0.751371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1342  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.361236 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  40 
 
 		 211 aa  171  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3710  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  41.98 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0845805 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1014  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.38 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1116  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.38 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.93 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.43 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1047  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.57 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000178019  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.71 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.23 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1028  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.06 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.198537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.56 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.17 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1769  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.68 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2125  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.41 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00642843 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1957  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.67 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.79 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2540  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.27 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0480192 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.33 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0476  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.07 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1509  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.65 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.96 
 
 		 225 aa  168  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.9 
 
 		 221 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.83 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.79 
 
 		 264 aa  168  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3605  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.29 
 
 		 218 aa  168  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.27 
 
 		 227 aa  168  6e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1918  Ribulose-phosphate 3-epimerase  41.96 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2632  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  41.29 
 
 		 217 aa  168  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.44 
 
 		 221 aa  167  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.44 
 
 		 221 aa  167  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0501  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.57 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  41.35 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.29 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>