More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2414 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2414  amino acid ABC transporter permease  100 
 
 
730 aa  1419    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7858  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.74 
 
 
394 aa  275  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2326  amino acid ABC transporter permease  42.65 
 
 
367 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4181  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.42 
 
 
369 aa  272  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1623  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.27 
 
 
779 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.528206  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0122  amino acid ABC transporter permease  43.44 
 
 
369 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3990  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.14 
 
 
369 aa  265  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03127  predicted amino-acid transporter subunit  45.01 
 
 
393 aa  265  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3564  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  45.01 
 
 
393 aa  265  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.982473  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03078  hypothetical protein  45.01 
 
 
393 aa  265  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2138  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.23 
 
 
366 aa  264  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4588  amino acid ABC transporter, permease protein, His/Glu/Gln/Arg/opine family  45.01 
 
 
393 aa  264  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0437  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.01 
 
 
393 aa  263  6e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3755  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  45.01 
 
 
393 aa  263  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0635797  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0437  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.01 
 
 
393 aa  263  6e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.81646  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3463  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  45.01 
 
 
393 aa  263  8.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.236631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1074  amino acid ABC transporter permease  42.52 
 
 
365 aa  262  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0912852  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0906  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.74 
 
 
365 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1257  amino acid ABC transporter, permease protein  41.47 
 
 
365 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.154586  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4426  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.97 
 
 
365 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4550  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.3 
 
 
365 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1299  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  41.69 
 
 
365 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.504897  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0054  inner membrane amino-acid ABC transporter permease protein  45.65 
 
 
360 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3558  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.83 
 
 
365 aa  259  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.650064 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2820  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  40.4 
 
 
359 aa  258  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.7628  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2824  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  40.4 
 
 
359 aa  258  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19415  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4394  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.68 
 
 
391 aa  255  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3654  amino acid ABC transporter, permease protein, His/Glu/Gln/Arg/opine family  41.55 
 
 
367 aa  253  7e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3585  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.12 
 
 
370 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124678  normal  0.0322156 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3756  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  41 
 
 
367 aa  251  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0586805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0975  amino acid ABC transporter permease  41.06 
 
 
365 aa  250  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03128  predicted amino-acid transporter subunit  41.86 
 
 
367 aa  250  7e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03079  hypothetical protein  41.86 
 
 
367 aa  250  7e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0436  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.86 
 
 
367 aa  250  7e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1073  amino acid ABC transporter permease  40.78 
 
 
393 aa  249  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0436  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.27 
 
 
367 aa  249  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3702  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.08 
 
 
392 aa  249  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4395  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.01 
 
 
366 aa  249  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0227  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.94 
 
 
362 aa  249  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3586  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.53 
 
 
398 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.174346  normal  0.0312139 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0738  amino acid ABC transporter, permease protein  41.16 
 
 
385 aa  248  3e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.76 
 
 
369 aa  247  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.794421  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0231  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.35 
 
 
364 aa  248  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1256  amino acid ABC transporter, permease protein  40.78 
 
 
393 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2911  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.21 
 
 
401 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469309  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1002  amino acid ABC transporter permease  43.02 
 
 
365 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2055  general L-amino acid ABC transporter permease protein  39.23 
 
 
365 aa  246  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169768  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
407 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0744  amino acid ABC transporter, permease protein  41.16 
 
 
385 aa  244  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2070  amino acid ABC transporter permease  39.63 
 
 
401 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.380407  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2555  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.88 
 
 
385 aa  244  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406061  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.6 
 
 
392 aa  243  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4589  general L-amino acid transport system permease protein AapM  41.41 
 
 
362 aa  244  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1758  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.1 
 
 
384 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.115192  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0973  amino acid ABC transporter, permease protein  40.22 
 
 
365 aa  243  7e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000454558  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3859  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.61 
 
 
364 aa  243  9e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136306  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2552  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  43.88 
 
 
398 aa  243  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1106  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.08 
 
 
384 aa  242  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3858  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.23 
 
 
392 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.155428  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0228  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.88 
 
 
392 aa  241  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6439  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.79 
 
 
384 aa  241  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.809326 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3559  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.94 
 
 
394 aa  241  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.527755 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1003  amino acid ABC transporter permease  44.47 
 
 
398 aa  240  8e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003415  amino acid ABC transporter permease protein  38.8 
 
 
365 aa  240  9e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000100001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1298  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  41.03 
 
 
392 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2559  amino acid ABC transporter permease  40.93 
 
 
401 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658439  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.34 
 
 
362 aa  239  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.277682  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7859  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.5 
 
 
403 aa  239  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02363  hypothetical protein  39.07 
 
 
365 aa  239  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1561  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
384 aa  239  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.670709 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4428  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.38 
 
 
362 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0906508  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3604  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
360 aa  238  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.436003  normal  0.0209416 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3709  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.45 
 
 
367 aa  238  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.218272 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3565  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  41.27 
 
 
367 aa  238  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3924  putative amino acid transport protein, permease protein  41.39 
 
 
383 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.96716  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2901  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.27 
 
 
362 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4180  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.32 
 
 
434 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1528  amino acid ABC transporter, inner membrane component  40.6 
 
 
401 aa  237  6e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426969  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4004  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.37 
 
 
396 aa  236  9e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0588648  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003416  amino acid ABC transporter permease protein  43.63 
 
 
401 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000534635  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3708  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
393 aa  235  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.223639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5871  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.62 
 
 
400 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.470509  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0121  amino acid ABC transporter permease  43.39 
 
 
392 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4427  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.03 
 
 
392 aa  234  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4551  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.6 
 
 
392 aa  234  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0905  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.46 
 
 
392 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0780  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.55 
 
 
387 aa  231  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1759  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.23 
 
 
400 aa  230  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400548  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2623  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.24 
 
 
362 aa  231  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724706  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1562  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.07 
 
 
400 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.360472  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0743  amino acid ABC transporter, permease protein  41.89 
 
 
397 aa  228  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0974  amino acid ABC transporter permease  40.46 
 
 
393 aa  228  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.97702  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2833  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.42 
 
 
401 aa  228  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18237  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2944  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.08 
 
 
352 aa  227  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2553  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  41.64 
 
 
395 aa  227  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186607  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
396 aa  227  7e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2556  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.3 
 
 
397 aa  226  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0737  amino acid ABC transporter, permease protein  41.33 
 
 
454 aa  226  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02362  ABC transporter permease  41.93 
 
 
390 aa  226  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2985  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.2 
 
 
400 aa  224  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.570925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>