158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0782 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0846  O-antigen export system, permease  100 
 
 		 256 aa  516  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000568855 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0782  O-antigen export system permease protein  100 
 
 		 256 aa  516  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.325104  normal  0.0451845 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0879  O-antigen export system, permease  99.61 
 
 		 256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.17819 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2055  ABC-2 type transporter  37.74 
 
 		 267 aa  205  5e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2139  ABC transporter permease protein  37.35 
 
 		 267 aa  202  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.479828  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0765  ABC-2 type transporter  38.28 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1878  ABC transporter permease protein  36.33 
 
 		 271 aa  198  7e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.725139 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2684  ABC-2 type transporter  39.53 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2740  ABC-2 type transporter  36.58 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0278  ABC-2 type transporter  35.36 
 
 		 288 aa  185  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13817  O-antigen/lipopolysaccharide transport integral membrane protein ABC transporter rfbD  35.52 
 
 		 280 aa  181  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4993  ABC-2 type transporter  34.36 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5081  ABC-2 type transporter  34.36 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5374  ABC-2 type transporter  34.36 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4323  ABC-2 type transporter  33.71 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5620  ABC-2 type transporter  34.75 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0134  ABC-2 type transporter  32.85 
 
 		 303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1184  ABC-2 type transporter  33.98 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4100  ABC-2 type transporter  33.72 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5659  putative O-antigene/LPS export system permease protein  33.46 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85695 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0490  ABC-2 type transporter  34.63 
 
 		 286 aa  164  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0741  ABC-2 type transporter  32.95 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2778  hypothetical protein  33.2 
 
 		 285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0744  ABC-2 type transporter  33.98 
 
 		 260 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01510  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  32.03 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0176682 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0394  ABC-2 type transporter  31.13 
 
 		 260 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0876  ABC-2 type transporter  31.13 
 
 		 260 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3139  ABC-2 type transporter  32.42 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.318534  normal  0.283866 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0847  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.107638 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6709  ABC-2 type transporter  32.42 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0486  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0717  O-antigen export system permease protein  27.24 
 
 		 287 aa  135  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0821  putative lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 		 287 aa  135  9e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  25.81 
 
 		 638 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4064  hypothetical protein  27.24 
 
 		 265 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2483  ABC-2 type transporter  25.19 
 
 		 273 aa  108  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4931  ABC-2 type transporter protein  28.16 
 
 		 216 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2626  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  26.14 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01381  hypothetical protein  24.51 
 
 		 276 aa  85.5  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0520  O-antigen export system permease protein RfbD  26.27 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0524  hypothetical protein  26.67 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3132  ABC-2 type transporter  22.78 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4966  teichoic acid translocation permease; teichoic acid ABC transporter, permease  24.24 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  23.97 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  26.12 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  25.44 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1218  putative ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  23.39 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.990833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  22.18 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  23.58 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1284  ABC-2 type transporter  23.11 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5119  techoic acid ABC transporter efflux permease  21.89 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5511  techoic acid ABC transporter efflux permease  21.89 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  24.45 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5361  putative techoic acid ABC transporter, efflux permease  21.89 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  23.05 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0370  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.9 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  26.22 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0495  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.32 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0237472  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  22.96 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  23.51 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  23.51 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0940  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  25.26 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  21.1 
 
 		 478 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  20.59 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  22.8 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20931  hypothetical protein  24.89 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129614  normal  0.872468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0610  hypothetical protein  23.53 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  19.75 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  21.6 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0704  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  23.53 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  24.9 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  24.9 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  24.31 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  21.94 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  24.9 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  24.9 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  24.9 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  24.9 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  24.9 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  22.61 
 
 		 288 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14690  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  20.53 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.544705  hitchhiker  0.00000217507 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  24.9 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 		 280 aa  52.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  21.4 
 
 		 275 aa  52.4  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0491  ABC-2 type transporter  20.74 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605473  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  20.75 
 
 		 275 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  20.43 
 
 		 275 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  22.71 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  19.3 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  21.17 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2410  ABC-2 type transporter  22.08 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  23.74 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  21.81 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2045  ABC-2 type transporter  23.32 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>