74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2483 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2483  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 273 aa  548  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0134  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5081  ABC-2 type transporter  28.84 
 
 		 276 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4993  ABC-2 type transporter  28.84 
 
 		 276 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5374  ABC-2 type transporter  28.84 
 
 		 276 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01510  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.62 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0176682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5620  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13817  O-antigen/lipopolysaccharide transport integral membrane protein ABC transporter rfbD  29.59 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1184  ABC-2 type transporter  29.59 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0490  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0278  ABC-2 type transporter  27.99 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4323  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 		 289 aa  122  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2684  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0717  O-antigen export system permease protein  26.42 
 
 		 287 aa  119  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3139  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 266 aa  118  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.318534  normal  0.283866 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0821  putative lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, permease protein  26.42 
 
 		 287 aa  118  9e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2740  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1878  ABC transporter permease protein  27.34 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.725139 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2139  ABC transporter permease protein  24.54 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.479828  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4064  hypothetical protein  28.68 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2055  ABC-2 type transporter  24.54 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0765  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0744  ABC-2 type transporter  25.28 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0876  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0394  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4100  ABC-2 type transporter  26.81 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0847  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.107638 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2778  hypothetical protein  26.54 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6709  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0782  O-antigen export system permease protein  25.19 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.325104  normal  0.0451845 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0846  O-antigen export system, permease  25.19 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000568855 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0879  O-antigen export system, permease  24.81 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.17819 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0486  ABC-2 type transporter  23.77 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5659  putative O-antigene/LPS export system permease protein  26.59 
 
 		 280 aa  92  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85695 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0741  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0520  O-antigen export system permease protein RfbD  29.23 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0524  hypothetical protein  29.23 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4931  ABC-2 type transporter protein  27.31 
 
 		 216 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2626  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  22.99 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  26.27 
 
 		 638 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3132  ABC-2 type transporter  23.18 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.82 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  24.05 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  23.02 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4966  teichoic acid translocation permease; teichoic acid ABC transporter, permease  26.52 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1846  ABC-2 type transporter  22.84 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.461285  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  22.89 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  23.45 
 
 		 274 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  23.6 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0491  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605473  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5511  techoic acid ABC transporter efflux permease  24.35 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5119  techoic acid ABC transporter efflux permease  24.35 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5361  putative techoic acid ABC transporter, efflux permease  24.35 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  23.91 
 
 		 276 aa  49.3  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0450  ABC-2 type transporter  23.27 
 
 		 276 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01381  hypothetical protein  22.22 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2410  ABC-2 type transporter  22.46 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0576  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  22.69 
 
 		 276 aa  46.2  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  17.06 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2692  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  24.77 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  23.77 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1686  ABC-2 type transporter  19.03 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  23.9 
 
 		 604 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 606 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1218  putative ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  28.71 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.990833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 258 aa  42.7  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3886  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 		 296 aa  42.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1284  ABC-2 type transporter  25.95 
 
 		 265 aa  42  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>