173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4993 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4993  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 276 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5081  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 276 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5374  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 276 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5620  ABC-2 type transporter  88.04 
 
 		 276 aa  467  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1184  ABC-2 type transporter  85.14 
 
 		 276 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13817  O-antigen/lipopolysaccharide transport integral membrane protein ABC transporter rfbD  81.07 
 
 		 280 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0278  ABC-2 type transporter  60.44 
 
 		 288 aa  332  4e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0134  ABC-2 type transporter  52.94 
 
 		 303 aa  313  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4323  ABC-2 type transporter  53.73 
 
 		 289 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4100  ABC-2 type transporter  56.46 
 
 		 285 aa  296  3e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01510  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  48.65 
 
 		 296 aa  279  5e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0176682 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1878  ABC transporter permease protein  39.33 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.725139 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2684  ABC-2 type transporter  40.61 
 
 		 267 aa  211  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2139  ABC transporter permease protein  39.85 
 
 		 267 aa  208  7e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.479828  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2055  ABC-2 type transporter  39.46 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2740  ABC-2 type transporter  38.58 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2778  hypothetical protein  39.77 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0486  ABC-2 type transporter  39.84 
 
 		 263 aa  195  6e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0744  ABC-2 type transporter  36.29 
 
 		 260 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0394  ABC-2 type transporter  35.52 
 
 		 260 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0876  ABC-2 type transporter  35.52 
 
 		 260 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0490  ABC-2 type transporter  40.41 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0717  O-antigen export system permease protein  33.08 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6709  ABC-2 type transporter  34.72 
 
 		 259 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0821  putative lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0782  O-antigen export system permease protein  34.36 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.325104  normal  0.0451845 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0846  O-antigen export system, permease  34.36 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000568855 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0847  ABC-2 type transporter  34.36 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.107638 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0879  O-antigen export system, permease  34.36 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.17819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0765  ABC-2 type transporter  33.95 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0741  ABC-2 type transporter  37.93 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3139  ABC-2 type transporter  34.34 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.318534  normal  0.283866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5659  putative O-antigene/LPS export system permease protein  29.77 
 
 		 280 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85695 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2483  ABC-2 type transporter  28.84 
 
 		 273 aa  139  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4064  hypothetical protein  30.04 
 
 		 265 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3132  ABC-2 type transporter  29.68 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0520  O-antigen export system permease protein RfbD  28.57 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0524  hypothetical protein  29.03 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4931  ABC-2 type transporter protein  27.62 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  28.78 
 
 		 638 aa  99  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2626  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  25.2 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01381  hypothetical protein  23.48 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1218  putative ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  22.43 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.990833  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  25.83 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  23.58 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  27.71 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  25.99 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  27 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  24.2 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  23.72 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  24 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 		 606 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  23.95 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  22.71 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0491  ABC-2 type transporter  22.82 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  22.86 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  27.9 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  24.05 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  22.59 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20931  hypothetical protein  23.55 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129614  normal  0.872468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 604 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  24.38 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  24.38 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  24.68 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  24.34 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  26.21 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  27.51 
 
 		 633 aa  62  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  25.53 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  22.89 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  23.45 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  22.69 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5119  techoic acid ABC transporter efflux permease  23.81 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5511  techoic acid ABC transporter efflux permease  23.81 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5361  putative techoic acid ABC transporter, efflux permease  23.81 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  22.09 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  23.17 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0208  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  21.43 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0325  ABC-2 type transporter  26.3 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.606531 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4966  teichoic acid translocation permease; teichoic acid ABC transporter, permease  22.92 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  21.65 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  23.32 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  23.05 
 
 		 570 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  25.84 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  21.07 
 
 		 478 aa  56.2  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>