62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0491 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0491  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 261 aa  522  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605473  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0278  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5374  ABC-2 type transporter  22.96 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5081  ABC-2 type transporter  22.96 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4993  ABC-2 type transporter  22.96 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4323  ABC-2 type transporter  21.83 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1878  ABC transporter permease protein  24.77 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.725139 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4100  ABC-2 type transporter  21.36 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5119  techoic acid ABC transporter efflux permease  25.12 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5511  techoic acid ABC transporter efflux permease  25.12 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0486  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0134  ABC-2 type transporter  20.69 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5361  putative techoic acid ABC transporter, efflux permease  25.12 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13817  O-antigen/lipopolysaccharide transport integral membrane protein ABC transporter rfbD  23.79 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2483  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3132  ABC-2 type transporter  25.84 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4966  teichoic acid translocation permease; teichoic acid ABC transporter, permease  25 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2139  ABC transporter permease protein  21 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.479828  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2055  ABC-2 type transporter  21 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0846  O-antigen export system, permease  20.74 
 
 		 256 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000568855 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0782  O-antigen export system permease protein  20.74 
 
 		 256 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.325104  normal  0.0451845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0765  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3139  ABC-2 type transporter  21.23 
 
 		 266 aa  52  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.318534  normal  0.283866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  23.65 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0490  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3116  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  25.24 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1184  ABC-2 type transporter  23.64 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0524  hypothetical protein  25.35 
 
 		 265 aa  49.7  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1846  ABC-2 type transporter  23.17 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.461285  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  22.78 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0297  tagG protein, teichoic acid ABC transporter protein, putative  23.35 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0520  O-antigen export system permease protein RfbD  25.35 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4931  ABC-2 type transporter protein  21.54 
 
 		 216 aa  49.3  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01381  hypothetical protein  23.47 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  23.6 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  23.6 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5620  ABC-2 type transporter  21.92 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  25.42 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01510  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  20.63 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0176682 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0879  O-antigen export system, permease  20.74 
 
 		 256 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.17819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4064  hypothetical protein  21.61 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1220  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 280 aa  45.4  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3312  ABC transporter protein  25.82 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0661  ABC-2 type transporter  21.13 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0928677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0676  ABC-2 type transporter  21.13 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.433122  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2778  hypothetical protein  24.34 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  24.27 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5659  putative O-antigene/LPS export system permease protein  27.01 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2740  ABC-2 type transporter  19.91 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3197  ABC-2 type transporter  24.26 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0717  O-antigen export system permease protein  20.7 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  20.48 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3015  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  24.4 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0998219  hitchhiker  0.0000148494 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0821  putative lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, permease protein  20.7 
 
 		 287 aa  43.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 283 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27980  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  21.05 
 
 		 300 aa  42.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  21 
 
 		 272 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  18.97 
 
 		 237 aa  42  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  22.5 
 
 		 258 aa  42  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>