173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0486 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0486  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 263 aa  522  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1878  ABC transporter permease protein  37.4 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.725139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4993  ABC-2 type transporter  38.37 
 
 		 276 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5081  ABC-2 type transporter  38.37 
 
 		 276 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5374  ABC-2 type transporter  38.37 
 
 		 276 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13817  O-antigen/lipopolysaccharide transport integral membrane protein ABC transporter rfbD  37.69 
 
 		 280 aa  182  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2740  ABC-2 type transporter  36.86 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4323  ABC-2 type transporter  34.21 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0847  ABC-2 type transporter  35.42 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.107638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0134  ABC-2 type transporter  35.25 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01510  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.71 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0176682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0278  ABC-2 type transporter  36.13 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5620  ABC-2 type transporter  36.68 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1184  ABC-2 type transporter  37.64 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2139  ABC transporter permease protein  31.64 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.479828  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2684  ABC-2 type transporter  33.71 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0744  ABC-2 type transporter  34.58 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2055  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 267 aa  166  5e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4100  ABC-2 type transporter  37.4 
 
 		 285 aa  165  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0394  ABC-2 type transporter  32.68 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0876  ABC-2 type transporter  32.68 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0717  O-antigen export system permease protein  31.15 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0821  putative lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, permease protein  31.15 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6709  ABC-2 type transporter  32.37 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0490  ABC-2 type transporter  36.99 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0741  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0765  ABC-2 type transporter  35.42 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2778  hypothetical protein  34.71 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0846  O-antigen export system, permease  30.2 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000568855 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0782  O-antigen export system permease protein  30.2 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.325104  normal  0.0451845 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0879  O-antigen export system, permease  30.2 
 
 		 256 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.17819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5659  putative O-antigene/LPS export system permease protein  28.15 
 
 		 280 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85695 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3139  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.318534  normal  0.283866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  33 
 
 		 638 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4064  hypothetical protein  31.51 
 
 		 265 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2483  ABC-2 type transporter  23.77 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2626  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  26.54 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01381  hypothetical protein  27.16 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4931  ABC-2 type transporter protein  29.65 
 
 		 216 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1218  putative ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  27.19 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.990833  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 606 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_004310  BR0520  O-antigen export system permease protein RfbD  28.29 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0524  hypothetical protein  28.29 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 604 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20931  hypothetical protein  26.03 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129614  normal  0.872468 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3132  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  23.63 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  28.84 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 288 aa  68.6  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  25.65 
 
 		 276 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  26.2 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  27.39 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  27.39 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  26.51 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26770  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  23.27 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.99915 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  26.57 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  21.81 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  25.64 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  23.73 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  25.49 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  27.27 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  25.23 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  25.84 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  23.67 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  22.57 
 
 		 570 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1846  ABC-2 type transporter  24.83 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.461285  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  23.92 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  31.62 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  25.6 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 478 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  25.6 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0450  ABC-2 type transporter  24.72 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  22.05 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  25.6 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  25.6 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  25.6 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  25.6 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  25.6 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  21.33 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  24.54 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  22.41 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  23.11 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>