51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_20931 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_20931  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129614  normal  0.872468 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1218  putative ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  65.64 
 
 
259 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.990833  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01381  hypothetical protein  43.87 
 
 
276 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0847  ABC-2 type transporter  30.3 
 
 
260 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.107638 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0486  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0744  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 
260 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1878  ABC transporter permease protein  27.6 
 
 
271 aa  90.5  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.725139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0394  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 
260 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0876  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 
260 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2055  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2139  ABC transporter permease protein  28.51 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.479828  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0821  putative lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, permease protein  29.55 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0717  O-antigen export system permease protein  29.55 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0490  ABC-2 type transporter  24.23 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0278  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4993  ABC-2 type transporter  23.55 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5081  ABC-2 type transporter  23.55 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4064  hypothetical protein  25.73 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5374  ABC-2 type transporter  23.55 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187664  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13817  O-antigen/lipopolysaccharide transport integral membrane protein ABC transporter rfbD  25.11 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6709  ABC-2 type transporter  23.61 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2740  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01510  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  24.14 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0176682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0134  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 
303 aa  72  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1184  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5620  ABC-2 type transporter  24.23 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_004310  BR0520  O-antigen export system permease protein RfbD  28.38 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0524  hypothetical protein  28.38 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5659  putative O-antigene/LPS export system permease protein  26.29 
 
 
280 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85695 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2778  hypothetical protein  24.77 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0741  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0782  O-antigen export system permease protein  24.89 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.325104  normal  0.0451845 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0846  O-antigen export system, permease  24.89 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000568855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3139  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.318534  normal  0.283866 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0879  O-antigen export system, permease  24.89 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.17819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4323  ABC-2 type transporter  20.16 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0765  ABC-2 type transporter  24.69 
 
 
267 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2684  ABC-2 type transporter  24.26 
 
 
267 aa  59.3  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3132  ABC-2 type transporter  24.03 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  25.37 
 
 
263 aa  56.2  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  23.11 
 
 
638 aa  55.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  28.41 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4100  ABC-2 type transporter  22.99 
 
 
285 aa  53.9  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2483  ABC-2 type transporter  24.34 
 
 
273 aa  50.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 
478 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2626  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  22.27 
 
 
264 aa  47  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  26.14 
 
 
264 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  22.89 
 
 
258 aa  45.8  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  25.43 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0495  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.23 
 
 
254 aa  43.9  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0237472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>