65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_01381 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_01381  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1218  putative ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  46.85 
 
 
259 aa  228  7e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.990833  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20931  hypothetical protein  43.87 
 
 
265 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129614  normal  0.872468 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1878  ABC transporter permease protein  28.05 
 
 
271 aa  96.3  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.725139 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2778  hypothetical protein  28.63 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0490  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 
286 aa  90.9  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0486  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 
263 aa  90.5  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0744  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 
260 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0741  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4064  hypothetical protein  28.44 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13817  O-antigen/lipopolysaccharide transport integral membrane protein ABC transporter rfbD  23.53 
 
 
280 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4993  ABC-2 type transporter  22.35 
 
 
276 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5374  ABC-2 type transporter  22.35 
 
 
276 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187664  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5081  ABC-2 type transporter  22.35 
 
 
276 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0394  ABC-2 type transporter  25.61 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0876  ABC-2 type transporter  25.61 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2740  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0847  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 
260 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.107638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0782  O-antigen export system permease protein  24.51 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.325104  normal  0.0451845 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0846  O-antigen export system, permease  24.51 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000568855 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2139  ABC transporter permease protein  25.96 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.479828  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3139  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.318534  normal  0.283866 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2055  ABC-2 type transporter  25.96 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5620  ABC-2 type transporter  23.6 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0278  ABC-2 type transporter  22.06 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  28.07 
 
 
638 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0879  O-antigen export system, permease  24.51 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.17819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1184  ABC-2 type transporter  24.31 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0765  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6709  ABC-2 type transporter  24.21 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0821  putative lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, permease protein  23.33 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0717  O-antigen export system permease protein  24.42 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4323  ABC-2 type transporter  22.05 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01510  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  22.71 
 
 
296 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0176682 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4100  ABC-2 type transporter  22.18 
 
 
285 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2626  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  24.15 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2684  ABC-2 type transporter  20.9 
 
 
267 aa  59.7  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0524  hypothetical protein  24.31 
 
 
265 aa  59.7  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0520  O-antigen export system permease protein RfbD  24.31 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0134  ABC-2 type transporter  22.13 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3132  ABC-2 type transporter  23.41 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  29.09 
 
 
264 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5659  putative O-antigene/LPS export system permease protein  23.14 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85695 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  27.12 
 
 
237 aa  50.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2483  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  22 
 
 
268 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.37 
 
 
296 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1686  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 
277 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0495  putative ABC-2 type transport system permease protein  20.88 
 
 
254 aa  45.8  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0237472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  26.13 
 
 
264 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4931  ABC-2 type transporter protein  22.17 
 
 
216 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3312  ABC transporter protein  24.46 
 
 
301 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0297  tagG protein, teichoic acid ABC transporter protein, putative  23.21 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0676  ABC-2 type transporter  21.89 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.433122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0661  ABC-2 type transporter  21.89 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0928677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  21.22 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  22.63 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4966  teichoic acid translocation permease; teichoic acid ABC transporter, permease  21.94 
 
 
268 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  26.7 
 
 
263 aa  42.7  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 
285 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 
261 aa  42.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 
276 aa  42.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  24.6 
 
 
275 aa  42.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  23.98 
 
 
257 aa  42  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>