171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0278 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0278  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 288 aa  579  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4993  ABC-2 type transporter  60.44 
 
 		 276 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5081  ABC-2 type transporter  60.44 
 
 		 276 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5374  ABC-2 type transporter  60.44 
 
 		 276 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13817  O-antigen/lipopolysaccharide transport integral membrane protein ABC transporter rfbD  62.64 
 
 		 280 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1184  ABC-2 type transporter  60.81 
 
 		 276 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5620  ABC-2 type transporter  60.81 
 
 		 276 aa  318  5e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0134  ABC-2 type transporter  51.35 
 
 		 303 aa  315  6e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4100  ABC-2 type transporter  54.23 
 
 		 285 aa  310  2.9999999999999997e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01510  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  48.64 
 
 		 296 aa  298  7e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0176682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4323  ABC-2 type transporter  51.09 
 
 		 289 aa  290  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1878  ABC transporter permease protein  40.07 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.725139 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2139  ABC transporter permease protein  39.02 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.479828  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2055  ABC-2 type transporter  38.64 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2684  ABC-2 type transporter  40.91 
 
 		 267 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2740  ABC-2 type transporter  36.63 
 
 		 283 aa  212  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0744  ABC-2 type transporter  36.7 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0847  ABC-2 type transporter  36.7 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.107638 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2778  hypothetical protein  37.84 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0394  ABC-2 type transporter  35.21 
 
 		 260 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0876  ABC-2 type transporter  35.21 
 
 		 260 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0741  ABC-2 type transporter  38.05 
 
 		 293 aa  195  9e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0486  ABC-2 type transporter  36.13 
 
 		 263 aa  193  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0846  O-antigen export system, permease  35.36 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000568855 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6709  ABC-2 type transporter  37.74 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0782  O-antigen export system permease protein  35.36 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.325104  normal  0.0451845 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0879  O-antigen export system, permease  35.36 
 
 		 256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.17819 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0490  ABC-2 type transporter  35.94 
 
 		 286 aa  175  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0765  ABC-2 type transporter  36.09 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0717  O-antigen export system permease protein  29.37 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0821  putative lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5659  putative O-antigene/LPS export system permease protein  33.21 
 
 		 280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85695 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3139  ABC-2 type transporter  31 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.318534  normal  0.283866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4064  hypothetical protein  31.37 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2483  ABC-2 type transporter  27.99 
 
 		 273 aa  130  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4931  ABC-2 type transporter protein  29.58 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  25.39 
 
 		 638 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0524  hypothetical protein  26.27 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0520  O-antigen export system permease protein RfbD  27.16 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2626  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  26.32 
 
 		 264 aa  92.8  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3132  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01381  hypothetical protein  22.48 
 
 		 276 aa  85.9  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1218  putative ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  21.8 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.990833  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.39 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1686  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0491  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605473  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  22.97 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5119  techoic acid ABC transporter efflux permease  27.13 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5511  techoic acid ABC transporter efflux permease  27.13 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5361  putative techoic acid ABC transporter, efflux permease  26.72 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  25.22 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  24.45 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20931  hypothetical protein  24.31 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129614  normal  0.872468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  24.62 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  26.87 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  21.4 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  21.15 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  27.07 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 		 633 aa  62.4  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4966  teichoic acid translocation permease; teichoic acid ABC transporter, permease  24.08 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  26.41 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  24.03 
 
 		 606 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  23.05 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  23.77 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  23.77 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  23.74 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  21.62 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  20.98 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  24.68 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  21.43 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  22.42 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 604 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  25.64 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  22 
 
 		 570 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  23.81 
 
 		 278 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0495  putative ABC-2 type transport system permease protein  22.62 
 
 		 254 aa  57  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0237472  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27980  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  24.24 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2045  ABC-2 type transporter  24.08 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  23.37 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  22.96 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  18.42 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  26.92 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  25.23 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  25.45 
 
 		 265 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3197  ABC-2 type transporter  23.51 
 
 		 282 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8935  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  22.87 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  22.22 
 
 		 275 aa  52.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  21.16 
 
 		 261 aa  52.4  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0208  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  22.33 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2433  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0840786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  22.78 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>