187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2684 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2684  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 267 aa  531  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2139  ABC transporter permease protein  60.92 
 
 		 267 aa  331  6e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.479828  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2055  ABC-2 type transporter  60.54 
 
 		 267 aa  329  2e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2740  ABC-2 type transporter  49.62 
 
 		 283 aa  281  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0394  ABC-2 type transporter  42.38 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0876  ABC-2 type transporter  42.38 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0744  ABC-2 type transporter  41.64 
 
 		 260 aa  241  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0847  ABC-2 type transporter  41.29 
 
 		 260 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.107638 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1878  ABC transporter permease protein  42.91 
 
 		 271 aa  236  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.725139 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6709  ABC-2 type transporter  43.46 
 
 		 259 aa  231  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2778  hypothetical protein  40.82 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1184  ABC-2 type transporter  43.68 
 
 		 276 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0134  ABC-2 type transporter  38.57 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13817  O-antigen/lipopolysaccharide transport integral membrane protein ABC transporter rfbD  41.31 
 
 		 280 aa  219  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4323  ABC-2 type transporter  39.25 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0278  ABC-2 type transporter  40.91 
 
 		 288 aa  215  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4993  ABC-2 type transporter  39.85 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5081  ABC-2 type transporter  39.85 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5374  ABC-2 type transporter  39.85 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5620  ABC-2 type transporter  41 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01510  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  36.3 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0176682 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0717  O-antigen export system permease protein  36.4 
 
 		 287 aa  208  9e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0821  putative lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, permease protein  36.02 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0782  O-antigen export system permease protein  39.53 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.325104  normal  0.0451845 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0846  O-antigen export system, permease  39.53 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000568855 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0741  ABC-2 type transporter  37.26 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4100  ABC-2 type transporter  37.3 
 
 		 285 aa  195  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0879  O-antigen export system, permease  39.53 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.17819 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3139  ABC-2 type transporter  41.29 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.318534  normal  0.283866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0765  ABC-2 type transporter  36.92 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0486  ABC-2 type transporter  33.71 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0490  ABC-2 type transporter  34.88 
 
 		 286 aa  175  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5659  putative O-antigene/LPS export system permease protein  34.24 
 
 		 280 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4064  hypothetical protein  29.07 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2483  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 		 273 aa  125  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4931  ABC-2 type transporter protein  33.49 
 
 		 216 aa  125  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  31.11 
 
 		 638 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2626  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  30.58 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0524  hypothetical protein  29.27 
 
 		 265 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0520  O-antigen export system permease protein RfbD  29.22 
 
 		 260 aa  112  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3132  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  26.86 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  25.39 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  28.25 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  24.31 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01381  hypothetical protein  22.6 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5119  techoic acid ABC transporter efflux permease  24.69 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5511  techoic acid ABC transporter efflux permease  24.69 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5361  putative techoic acid ABC transporter, efflux permease  24.69 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  24.35 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 570 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  25.39 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 		 274 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 282 aa  62  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  25.46 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  26.47 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1218  putative ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  24.04 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.990833  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  28.46 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  22.62 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  23.25 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  23.96 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  30.49 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  26.79 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  23.79 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  28.46 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  25 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  26 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  23.61 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  23.65 
 
 		 283 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  25.55 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  28.75 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4966  teichoic acid translocation permease; teichoic acid ABC transporter, permease  21.9 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  26.47 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  26.47 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  26.47 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  26.47 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  26.47 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  26.47 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  26.47 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 		 604 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 606 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  23.83 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  23.18 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  22 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  25.29 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  21.1 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>