202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2740 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2740  ABC-2 type transporter  100 
 
 
283 aa  570  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2055  ABC-2 type transporter  51.72 
 
 
267 aa  296  2e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2139  ABC transporter permease protein  51.72 
 
 
267 aa  296  2e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.479828  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2684  ABC-2 type transporter  49.62 
 
 
267 aa  271  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1878  ABC transporter permease protein  40.23 
 
 
271 aa  218  7.999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.725139 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4323  ABC-2 type transporter  38.24 
 
 
289 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0744  ABC-2 type transporter  42.15 
 
 
260 aa  211  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0847  ABC-2 type transporter  40.23 
 
 
260 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.107638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0394  ABC-2 type transporter  41.38 
 
 
260 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0876  ABC-2 type transporter  41.38 
 
 
260 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0278  ABC-2 type transporter  36.63 
 
 
288 aa  205  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0717  O-antigen export system permease protein  38.08 
 
 
287 aa  202  3e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0821  putative lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, permease protein  37.68 
 
 
287 aa  203  3e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01510  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  36.18 
 
 
296 aa  199  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0176682 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6709  ABC-2 type transporter  39.62 
 
 
259 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2778  hypothetical protein  38.64 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0741  ABC-2 type transporter  37.88 
 
 
293 aa  195  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0134  ABC-2 type transporter  34.8 
 
 
303 aa  195  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4993  ABC-2 type transporter  38.58 
 
 
276 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5081  ABC-2 type transporter  38.58 
 
 
276 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5374  ABC-2 type transporter  38.58 
 
 
276 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187664  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4100  ABC-2 type transporter  38.64 
 
 
285 aa  188  9e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13817  O-antigen/lipopolysaccharide transport integral membrane protein ABC transporter rfbD  36.05 
 
 
280 aa  186  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0846  O-antigen export system, permease  36.58 
 
 
256 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000568855 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0782  O-antigen export system permease protein  36.58 
 
 
256 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.325104  normal  0.0451845 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1184  ABC-2 type transporter  38.37 
 
 
276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0879  O-antigen export system, permease  36.58 
 
 
256 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.17819 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0486  ABC-2 type transporter  36.86 
 
 
263 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5620  ABC-2 type transporter  36.43 
 
 
276 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0490  ABC-2 type transporter  36.12 
 
 
286 aa  175  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3139  ABC-2 type transporter  33.08 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.318534  normal  0.283866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0765  ABC-2 type transporter  34.62 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5659  putative O-antigene/LPS export system permease protein  33.05 
 
 
280 aa  135  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4064  hypothetical protein  29.69 
 
 
265 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2483  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 
273 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4931  ABC-2 type transporter protein  31.73 
 
 
216 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2626  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  29.78 
 
 
264 aa  113  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3132  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 
260 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0520  O-antigen export system permease protein RfbD  26.56 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0524  hypothetical protein  26.56 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  24.21 
 
 
638 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  27.23 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  27.85 
 
 
478 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  27.12 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01381  hypothetical protein  27.09 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  27.09 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  27.62 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  28.44 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  24.47 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  23.96 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  30.24 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1686  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  23.28 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  23.65 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  29.41 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  28.9 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  26.63 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5119  techoic acid ABC transporter efflux permease  26.59 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5511  techoic acid ABC transporter efflux permease  26.59 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  24.91 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  24.17 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2045  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 
266 aa  63.9  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  23.77 
 
 
278 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 
276 aa  63.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  22.86 
 
 
570 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5361  putative techoic acid ABC transporter, efflux permease  26.19 
 
 
268 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 
263 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  24.27 
 
 
265 aa  62.8  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 
268 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 
277 aa  62.4  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  22.98 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  23.91 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  24.68 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0370  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.63 
 
 
255 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  25.23 
 
 
278 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 
298 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 
294 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2410  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 
272 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  23.74 
 
 
278 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 
283 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4966  teichoic acid translocation permease; teichoic acid ABC transporter, permease  26.56 
 
 
268 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 
278 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 
278 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 
604 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  25.78 
 
 
283 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  24.53 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.693027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>