126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5659 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5659  putative O-antigene/LPS export system permease protein  100 
 
 		 280 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85695 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2139  ABC transporter permease protein  34.38 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.479828  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2055  ABC-2 type transporter  33.98 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2684  ABC-2 type transporter  34.24 
 
 		 267 aa  171  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0782  O-antigen export system permease protein  33.46 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.325104  normal  0.0451845 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0846  O-antigen export system, permease  33.46 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000568855 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1878  ABC transporter permease protein  31.8 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.725139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0879  O-antigen export system, permease  33.46 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.17819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4323  ABC-2 type transporter  33.97 
 
 		 289 aa  158  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0278  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13817  O-antigen/lipopolysaccharide transport integral membrane protein ABC transporter rfbD  31.3 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0134  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2740  ABC-2 type transporter  33.05 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5620  ABC-2 type transporter  32.22 
 
 		 276 aa  148  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1184  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4100  ABC-2 type transporter  32 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2778  hypothetical protein  32.78 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0394  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0876  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0847  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.107638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0765  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4993  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 276 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5081  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 276 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5374  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 276 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0717  O-antigen export system permease protein  31.43 
 
 		 287 aa  145  9e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0821  putative lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, permease protein  31.43 
 
 		 287 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0490  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0744  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0741  ABC-2 type transporter  31.35 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3139  ABC-2 type transporter  28.98 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.318534  normal  0.283866 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01510  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.45 
 
 		 296 aa  135  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0176682 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6709  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0486  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  32.21 
 
 		 638 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4064  hypothetical protein  29.67 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3132  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2483  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4931  ABC-2 type transporter protein  29.23 
 
 		 216 aa  96.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2626  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  27.69 
 
 		 264 aa  92.8  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0524  hypothetical protein  26 
 
 		 265 aa  92.8  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0520  O-antigen export system permease protein RfbD  26 
 
 		 260 aa  92.8  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  24.65 
 
 		 570 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  23.32 
 
 		 606 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  24.72 
 
 		 604 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  23.7 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0208  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  22.64 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5119  techoic acid ABC transporter efflux permease  23.32 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5511  techoic acid ABC transporter efflux permease  23.32 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5361  putative techoic acid ABC transporter, efflux permease  23.32 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  23.46 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  22.08 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  24.23 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01381  hypothetical protein  23.14 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  25.96 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  24.89 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20931  hypothetical protein  26.29 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129614  normal  0.872468 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  24.28 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  24.07 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2362  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  22.82 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  23.79 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  21.05 
 
 		 478 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2310  ABC-2 type transporter  25.96 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  23.15 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  20.4 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  21.92 
 
 		 278 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  21.92 
 
 		 278 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  21.58 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 316 aa  51.6  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  19.82 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  24.15 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  25.35 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2433  ABC-2 type transporter  23.93 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0840786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3932  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.182483  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  18.89 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  21.52 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  19.43 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  21.3 
 
 		 278 aa  49.7  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  22.55 
 
 		 287 aa  49.3  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 292 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1218  putative ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  21.13 
 
 		 259 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.990833  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0491  ABC-2 type transporter  22.45 
 
 		 261 aa  49.3  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605473  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  23.85 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3884  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0325  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.606531 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4966  teichoic acid translocation permease; teichoic acid ABC transporter, permease  24.14 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  21.34 
 
 		 259 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  22.12 
 
 		 275 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>