176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0297 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0297  tagG protein, teichoic acid ABC transporter protein, putative  100 
 
 		 270 aa  540  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0661  ABC-2 type transporter  78.89 
 
 		 270 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0928677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0676  ABC-2 type transporter  78.89 
 
 		 270 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.433122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5119  techoic acid ABC transporter efflux permease  42.07 
 
 		 268 aa  225  7e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5511  techoic acid ABC transporter efflux permease  42.07 
 
 		 268 aa  225  7e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5361  putative techoic acid ABC transporter, efflux permease  41.7 
 
 		 268 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4966  teichoic acid translocation permease; teichoic acid ABC transporter, permease  39.48 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 		 270 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0263  ABC-2 type transporter, permease protein  26.87 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0254  teichoic acid translocation permease protein  26.49 
 
 		 270 aa  99  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14690  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.83 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.544705  hitchhiker  0.00000217507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  25.64 
 
 		 284 aa  90.1  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2410  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  27.23 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1573  polysaccharide/polyol phosphate export systems permease  27.5 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.445511  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  24.62 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  23.95 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  24.54 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1846  ABC-2 type transporter  24.68 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.461285  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  22.61 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  24.18 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3197  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  23.39 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  27.34 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  23.55 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  24.91 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3116  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  25 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  20.77 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  22.87 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  21.76 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  24.33 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  23.97 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  21.56 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  25.29 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  24.9 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  22.39 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  24.11 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  24.45 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  23.6 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26460  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.36 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  24.45 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  23.14 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8935  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  25.38 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  21.21 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 570 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  23.22 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  22.73 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3312  ABC transporter protein  24.21 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  22.27 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3946  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.346404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  21.59 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  23.04 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  22.58 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1220  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  21.35 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  22.96 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0370  putative ABC-2 type transport system permease protein  20.53 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  18.95 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0208  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  27.68 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  20.97 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  22.71 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0741  ABC-2 type transporter  25.44 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  24.57 
 
 		 282 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  26.01 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  23.41 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  24.5 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  24.5 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  24.5 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  22.3 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  24.5 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  24.5 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  24.5 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  24.5 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  25.26 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  21.77 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  26.24 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 604 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>