164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3015 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3015  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  100 
 
 		 257 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0998219  hitchhiker  0.0000148494 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1284  ABC-2 type transporter  34.17 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  31.58 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2634  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.79755  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  24.36 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1220  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.69 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1686  ABC-2 type transporter  25.23 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  23.74 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8935  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  29.05 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 570 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1846  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.461285  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 		 278 aa  72  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 633 aa  72  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  26.7 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26460  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  24.34 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0860  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  25.45 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  25.84 
 
 		 606 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  21.29 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  24.37 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  24.68 
 
 		 604 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  23.29 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  23.62 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  25.48 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  25.48 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  25.48 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  25.48 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  25.48 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  25.48 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  25.48 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  22.13 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  25.58 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  25.1 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  23.29 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02828  Polysialic acid transport protein kpsM  25.36 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02777  hypothetical protein  25.36 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000408892  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  24.17 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  21.65 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  26.45 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  23.46 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  23.55 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  25.53 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3116  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  23.71 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  25.99 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  23.29 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3312  ABC transporter protein  25.99 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  25.55 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26770  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  22.52 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.99915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  24.39 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3197  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  21.03 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  23.45 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  21.58 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  23.41 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  25.73 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  21.69 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  24.68 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  23.46 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  24.58 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  28.86 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2410  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3235  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsM  24.88 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586026  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  20.78 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  23.87 
 
 		 283 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  25.11 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  22.52 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4146  ABC-2 type transporter  22.98 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  hitchhiker  0.00000138 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27980  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  23.53 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09070  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.46 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00126145  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  23.47 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  23.02 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  20.09 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  19.75 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  23.22 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  21.72 
 
 		 316 aa  53.1  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 		 279 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  22.22 
 
 		 271 aa  52.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  21.43 
 
 		 274 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  24.27 
 
 		 284 aa  52.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  26.12 
 
 		 301 aa  52  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  22.57 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  22.12 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2045  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4589  ABC-2 type transporter  24.15 
 
 		 280 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0519  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48708  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  22.28 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>