More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1945 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1945  drug transporter, putative  100 
 
 		 215 aa  426  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2377  hypothetical protein  82.79 
 
 		 215 aa  367  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2423  hypothetical protein  82.79 
 
 		 215 aa  367  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2429  Multidrug resistance efflux pump-like protein  42.52 
 
 		 214 aa  194  9e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.310054  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4700  hypothetical protein  43.72 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000255246  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1834  multidrug resistance protein A  44.19 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00170419  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3255  multidrug resistance protein A  45.12 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2910  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  40.93 
 
 		 228 aa  184  9e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000263786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0560  hypothetical protein  44.65 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000264688  hitchhiker  1.67598e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2447  hypothetical protein  40.93 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4677  hypothetical protein  44.19 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4465  hypothetical protein  44.19 
 
 		 217 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4300  multidrug resistance protein A  44.19 
 
 		 217 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000026909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4311  multidrug resistance protein A  44.19 
 
 		 217 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4693  hypothetical protein  44.19 
 
 		 217 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000853008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4813  hypothetical protein  44.19 
 
 		 217 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0590873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4684  hypothetical protein  44.19 
 
 		 217 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12554e-48 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4400  hypothetical protein  43.26 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0106934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4149  hypothetical protein  36.65 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.247441  hitchhiker  0.00000117092 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0454  secretion protein HlyD  37.62 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0099  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  35.38 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2016  secretion protein HlyD family protein  35.21 
 
 		 517 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2323  secretion protein HlyD  32.37 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000671168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  32.79 
 
 		 394 aa  95.9  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  34.97 
 
 		 400 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  35.16 
 
 		 363 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3361  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 373 aa  85.5  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  35.82 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  34.38 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  34.38 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  38.71 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1203  secretion protein HlyD family protein  36.59 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0133764  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  32.31 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  32.31 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  33.59 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  33.59 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3253  secretion protein HlyD family protein  34.38 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  28.91 
 
 		 371 aa  82.4  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  32.43 
 
 		 351 aa  82  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  32.31 
 
 		 363 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  37.9 
 
 		 385 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  32.81 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  43.01 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  35.25 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  34.88 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2222  secretion protein HlyD family protein  35.45 
 
 		 364 aa  79.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.0630551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  33.33 
 
 		 372 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  33.61 
 
 		 368 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  35.38 
 
 		 355 aa  78.2  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  41.94 
 
 		 375 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  35.77 
 
 		 374 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  32.59 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  35.66 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  34.81 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  34.81 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  34.81 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  28.89 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  29.28 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  37.38 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  34.11 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  29.13 
 
 		 356 aa  75.9  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  32.84 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  34.38 
 
 		 347 aa  75.5  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  31.5 
 
 		 332 aa  75.5  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  33.86 
 
 		 369 aa  75.5  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 352 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 352 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 352 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  31.3 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  33.33 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  33.13 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  31.75 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  31.03 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  35.65 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  34.11 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48280  putative multidrug resistance efflux pump  29.03 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0160418  normal  0.0591644 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  32.56 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  32.3 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  31.48 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01156  multidrug resistance efflux pump  30.23 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  31.4 
 
 		 410 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  29.37 
 
 		 374 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  29.37 
 
 		 374 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4511  secretion protein HlyD family protein  33.93 
 
 		 397 aa  72.4  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  29.37 
 
 		 374 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2377  secretion protein HlyD family protein  30.83 
 
 		 348 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  35.65 
 
 		 366 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1574  secretion protein HlyD  31.25 
 
 		 348 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  34.13 
 
 		 402 aa  71.6  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  33.08 
 
 		 413 aa  71.6  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2289  secretion protein HlyD family protein  30.77 
 
 		 348 aa  71.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4053  secretion protein HlyD family protein  32.28 
 
 		 349 aa  71.6  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  39.05 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  33.59 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  35.38 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  32.61 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0460  multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  35.94 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  31.79 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>